Protein–RNA interactions for Protein: P53564

Cux1, Homeobox protein cut-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux1P53564 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cux1P53564 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Cux1P53564 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cux1P53564 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cux1P53564 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cux1P53564 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cux1P53564 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cux1P53564 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cux1P53564 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cux1P53564 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cux1P53564 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cux1P53564 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cux1P53564 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cux1P53564 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cux1P53564 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cux1P53564 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cux1P53564 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cux1P53564 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Cux1P53564 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cux1P53564 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Cux1P53564 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cux1P53564 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cux1P53564 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cux1P53564 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cux1P53564 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cux1P53564 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cux1P53564 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cux1P53564 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cux1P53564 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cux1P53564 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cux1P53564 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cux1P53564 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cux1P53564 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cux1P53564 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cux1P53564 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cux1P53564 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cux1P53564 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cux1P53564 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cux1P53564 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Cux1P53564 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Cux1P53564 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Cux1P53564 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Cux1P53564 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Cux1P53564 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Cux1P53564 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Cux1P53564 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Cux1P53564 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Cux1P53564 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Cux1P53564 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cux1P53564 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cux1P53564 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cux1P53564 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Cux1P53564 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cux1P53564 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cux1P53564 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cux1P53564 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cux1P53564 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cux1P53564 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cux1P53564 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cux1P53564 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cux1P53564 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cux1P53564 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Cux1P53564 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cux1P53564 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cux1P53564 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cux1P53564 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Cux1P53564 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cux1P53564 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cux1P53564 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cux1P53564 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cux1P53564 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Cux1P53564 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cux1P53564 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cux1P53564 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cux1P53564 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cux1P53564 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cux1P53564 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cux1P53564 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cux1P53564 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cux1P53564 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cux1P53564 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cux1P53564 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cux1P53564 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Cux1P53564 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cux1P53564 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cux1P53564 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cux1P53564 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cux1P53564 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cux1P53564 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cux1P53564 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cux1P53564 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cux1P53564 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cux1P53564 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Cux1P53564 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Cux1P53564 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cux1P53564 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cux1P53564 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Cux1P53564 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cux1P53564 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Cux1P53564 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms