Protein–RNA interactions for Protein: P52483

Ube2e3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2e3P52483 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ube2e3P52483 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ube2e3P52483 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ube2e3P52483 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ube2e3P52483 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ube2e3P52483 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ube2e3P52483 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ube2e3P52483 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ube2e3P52483 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ube2e3P52483 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ube2e3P52483 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ube2e3P52483 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ube2e3P52483 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ube2e3P52483 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ube2e3P52483 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ube2e3P52483 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ube2e3P52483 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ube2e3P52483 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ube2e3P52483 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ube2e3P52483 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ube2e3P52483 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ube2e3P52483 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ube2e3P52483 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ube2e3P52483 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ube2e3P52483 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ube2e3P52483 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ube2e3P52483 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ube2e3P52483 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ube2e3P52483 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ube2e3P52483 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ube2e3P52483 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ube2e3P52483 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ube2e3P52483 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ube2e3P52483 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ube2e3P52483 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ube2e3P52483 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ube2e3P52483 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ube2e3P52483 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ube2e3P52483 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ube2e3P52483 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ube2e3P52483 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ube2e3P52483 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ube2e3P52483 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ube2e3P52483 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ube2e3P52483 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ube2e3P52483 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ube2e3P52483 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ube2e3P52483 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ube2e3P52483 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ube2e3P52483 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ube2e3P52483 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ube2e3P52483 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ube2e3P52483 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ube2e3P52483 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ube2e3P52483 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ube2e3P52483 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ube2e3P52483 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ube2e3P52483 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ube2e3P52483 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ube2e3P52483 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ube2e3P52483 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ube2e3P52483 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ube2e3P52483 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ube2e3P52483 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ube2e3P52483 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ube2e3P52483 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ube2e3P52483 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ube2e3P52483 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ube2e3P52483 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ube2e3P52483 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ube2e3P52483 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ube2e3P52483 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ube2e3P52483 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ube2e3P52483 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ube2e3P52483 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ube2e3P52483 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ube2e3P52483 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ube2e3P52483 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ube2e3P52483 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ube2e3P52483 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ube2e3P52483 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ube2e3P52483 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ube2e3P52483 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ube2e3P52483 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ube2e3P52483 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ube2e3P52483 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ube2e3P52483 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ube2e3P52483 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ube2e3P52483 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ube2e3P52483 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ube2e3P52483 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ube2e3P52483 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ube2e3P52483 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ube2e3P52483 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ube2e3P52483 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ube2e3P52483 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ube2e3P52483 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ube2e3P52483 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ube2e3P52483 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ube2e3P52483 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms