Protein–RNA interactions for Protein: P52194

Clgn, Calmegin, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClgnP52194 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ClgnP52194 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ClgnP52194 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ClgnP52194 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ClgnP52194 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ClgnP52194 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ClgnP52194 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ClgnP52194 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ClgnP52194 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ClgnP52194 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ClgnP52194 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ClgnP52194 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ClgnP52194 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ClgnP52194 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ClgnP52194 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ClgnP52194 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ClgnP52194 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ClgnP52194 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ClgnP52194 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ClgnP52194 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ClgnP52194 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ClgnP52194 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ClgnP52194 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ClgnP52194 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ClgnP52194 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ClgnP52194 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ClgnP52194 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ClgnP52194 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ClgnP52194 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ClgnP52194 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ClgnP52194 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ClgnP52194 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ClgnP52194 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ClgnP52194 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ClgnP52194 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ClgnP52194 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ClgnP52194 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ClgnP52194 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ClgnP52194 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ClgnP52194 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ClgnP52194 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ClgnP52194 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ClgnP52194 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ClgnP52194 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ClgnP52194 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ClgnP52194 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ClgnP52194 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ClgnP52194 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ClgnP52194 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ClgnP52194 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ClgnP52194 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ClgnP52194 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ClgnP52194 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ClgnP52194 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ClgnP52194 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ClgnP52194 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ClgnP52194 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ClgnP52194 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ClgnP52194 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ClgnP52194 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ClgnP52194 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ClgnP52194 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ClgnP52194 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ClgnP52194 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ClgnP52194 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ClgnP52194 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ClgnP52194 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ClgnP52194 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ClgnP52194 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ClgnP52194 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ClgnP52194 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ClgnP52194 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ClgnP52194 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ClgnP52194 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ClgnP52194 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ClgnP52194 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ClgnP52194 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ClgnP52194 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ClgnP52194 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ClgnP52194 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ClgnP52194 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ClgnP52194 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ClgnP52194 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ClgnP52194 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ClgnP52194 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ClgnP52194 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ClgnP52194 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ClgnP52194 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ClgnP52194 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ClgnP52194 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ClgnP52194 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ClgnP52194 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ClgnP52194 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ClgnP52194 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ClgnP52194 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ClgnP52194 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ClgnP52194 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ClgnP52194 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ClgnP52194 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ClgnP52194 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms