Protein–RNA interactions for Protein: P51910

Apod, Apolipoprotein D, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApodP51910 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ApodP51910 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ApodP51910 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ApodP51910 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ApodP51910 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ApodP51910 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ApodP51910 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ApodP51910 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ApodP51910 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ApodP51910 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ApodP51910 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ApodP51910 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ApodP51910 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ApodP51910 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ApodP51910 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ApodP51910 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ApodP51910 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ApodP51910 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ApodP51910 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ApodP51910 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ApodP51910 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ApodP51910 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ApodP51910 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ApodP51910 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ApodP51910 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ApodP51910 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ApodP51910 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ApodP51910 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ApodP51910 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ApodP51910 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ApodP51910 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ApodP51910 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ApodP51910 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ApodP51910 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ApodP51910 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ApodP51910 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ApodP51910 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ApodP51910 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ApodP51910 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ApodP51910 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ApodP51910 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ApodP51910 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ApodP51910 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ApodP51910 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ApodP51910 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ApodP51910 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ApodP51910 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ApodP51910 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ApodP51910 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ApodP51910 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ApodP51910 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ApodP51910 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ApodP51910 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ApodP51910 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ApodP51910 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ApodP51910 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ApodP51910 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ApodP51910 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
ApodP51910 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ApodP51910 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ApodP51910 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ApodP51910 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ApodP51910 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ApodP51910 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ApodP51910 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ApodP51910 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ApodP51910 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ApodP51910 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ApodP51910 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ApodP51910 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ApodP51910 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ApodP51910 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ApodP51910 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ApodP51910 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ApodP51910 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ApodP51910 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ApodP51910 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ApodP51910 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ApodP51910 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ApodP51910 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ApodP51910 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ApodP51910 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ApodP51910 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ApodP51910 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ApodP51910 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ApodP51910 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ApodP51910 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ApodP51910 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ApodP51910 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ApodP51910 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ApodP51910 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ApodP51910 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ApodP51910 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ApodP51910 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ApodP51910 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ApodP51910 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ApodP51910 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ApodP51910 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ApodP51910 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ApodP51910 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.9 ms