Protein–RNA interactions for Protein: P49817

Cav1, Caveolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cav1P49817 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cav1P49817 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cav1P49817 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cav1P49817 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cav1P49817 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cav1P49817 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cav1P49817 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Cav1P49817 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cav1P49817 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cav1P49817 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cav1P49817 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cav1P49817 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cav1P49817 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cav1P49817 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cav1P49817 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cav1P49817 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cav1P49817 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cav1P49817 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cav1P49817 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cav1P49817 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cav1P49817 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cav1P49817 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cav1P49817 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cav1P49817 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cav1P49817 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cav1P49817 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cav1P49817 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cav1P49817 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cav1P49817 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cav1P49817 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cav1P49817 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cav1P49817 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cav1P49817 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cav1P49817 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cav1P49817 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cav1P49817 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cav1P49817 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Cav1P49817 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cav1P49817 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cav1P49817 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cav1P49817 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Cav1P49817 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cav1P49817 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cav1P49817 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cav1P49817 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Cav1P49817 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Cav1P49817 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cav1P49817 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cav1P49817 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cav1P49817 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cav1P49817 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cav1P49817 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cav1P49817 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cav1P49817 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Cav1P49817 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Cav1P49817 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cav1P49817 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cav1P49817 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cav1P49817 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cav1P49817 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cav1P49817 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cav1P49817 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cav1P49817 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cav1P49817 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cav1P49817 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cav1P49817 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cav1P49817 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cav1P49817 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cav1P49817 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cav1P49817 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cav1P49817 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cav1P49817 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cav1P49817 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cav1P49817 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cav1P49817 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cav1P49817 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cav1P49817 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cav1P49817 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cav1P49817 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cav1P49817 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cav1P49817 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cav1P49817 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cav1P49817 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cav1P49817 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cav1P49817 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cav1P49817 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cav1P49817 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cav1P49817 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cav1P49817 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cav1P49817 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cav1P49817 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cav1P49817 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cav1P49817 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cav1P49817 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cav1P49817 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cav1P49817 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cav1P49817 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cav1P49817 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cav1P49817 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cav1P49817 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms