Protein–RNA interactions for Protein: P49710

Hcls1, Hematopoietic lineage cell-specific protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcls1P49710 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hcls1P49710 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hcls1P49710 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hcls1P49710 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hcls1P49710 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hcls1P49710 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hcls1P49710 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hcls1P49710 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hcls1P49710 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hcls1P49710 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hcls1P49710 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hcls1P49710 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hcls1P49710 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hcls1P49710 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hcls1P49710 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hcls1P49710 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hcls1P49710 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hcls1P49710 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hcls1P49710 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hcls1P49710 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Hcls1P49710 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hcls1P49710 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hcls1P49710 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hcls1P49710 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hcls1P49710 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hcls1P49710 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hcls1P49710 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hcls1P49710 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hcls1P49710 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hcls1P49710 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hcls1P49710 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hcls1P49710 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hcls1P49710 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hcls1P49710 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hcls1P49710 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hcls1P49710 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hcls1P49710 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hcls1P49710 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hcls1P49710 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hcls1P49710 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hcls1P49710 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hcls1P49710 Gm37444-201ENSMUST00000193605 439 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Hcls1P49710 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Hcls1P49710 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hcls1P49710 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hcls1P49710 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hcls1P49710 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hcls1P49710 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hcls1P49710 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hcls1P49710 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hcls1P49710 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hcls1P49710 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hcls1P49710 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hcls1P49710 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hcls1P49710 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hcls1P49710 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hcls1P49710 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hcls1P49710 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hcls1P49710 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hcls1P49710 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hcls1P49710 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hcls1P49710 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hcls1P49710 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hcls1P49710 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hcls1P49710 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hcls1P49710 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hcls1P49710 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hcls1P49710 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hcls1P49710 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hcls1P49710 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hcls1P49710 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hcls1P49710 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Hcls1P49710 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hcls1P49710 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hcls1P49710 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hcls1P49710 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hcls1P49710 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hcls1P49710 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hcls1P49710 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hcls1P49710 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Hcls1P49710 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hcls1P49710 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hcls1P49710 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hcls1P49710 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hcls1P49710 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hcls1P49710 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hcls1P49710 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hcls1P49710 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hcls1P49710 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hcls1P49710 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hcls1P49710 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Hcls1P49710 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hcls1P49710 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hcls1P49710 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hcls1P49710 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hcls1P49710 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hcls1P49710 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hcls1P49710 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hcls1P49710 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hcls1P49710 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms