Protein–RNA interactions for Protein: P49429

Hpd, 4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HpdP49429 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
HpdP49429 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
HpdP49429 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
HpdP49429 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HpdP49429 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HpdP49429 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HpdP49429 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HpdP49429 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HpdP49429 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
HpdP49429 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HpdP49429 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HpdP49429 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HpdP49429 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HpdP49429 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HpdP49429 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HpdP49429 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HpdP49429 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HpdP49429 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HpdP49429 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HpdP49429 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HpdP49429 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HpdP49429 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HpdP49429 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HpdP49429 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HpdP49429 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HpdP49429 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
HpdP49429 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HpdP49429 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HpdP49429 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HpdP49429 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HpdP49429 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HpdP49429 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HpdP49429 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HpdP49429 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HpdP49429 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
HpdP49429 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HpdP49429 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HpdP49429 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HpdP49429 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
HpdP49429 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HpdP49429 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HpdP49429 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HpdP49429 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HpdP49429 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HpdP49429 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HpdP49429 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HpdP49429 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HpdP49429 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HpdP49429 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HpdP49429 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HpdP49429 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HpdP49429 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HpdP49429 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HpdP49429 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HpdP49429 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HpdP49429 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HpdP49429 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HpdP49429 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HpdP49429 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HpdP49429 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HpdP49429 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HpdP49429 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HpdP49429 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HpdP49429 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HpdP49429 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HpdP49429 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HpdP49429 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HpdP49429 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HpdP49429 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HpdP49429 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HpdP49429 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
HpdP49429 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HpdP49429 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
HpdP49429 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HpdP49429 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HpdP49429 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HpdP49429 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HpdP49429 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HpdP49429 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HpdP49429 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HpdP49429 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HpdP49429 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
HpdP49429 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HpdP49429 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HpdP49429 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HpdP49429 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HpdP49429 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HpdP49429 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HpdP49429 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HpdP49429 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HpdP49429 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HpdP49429 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HpdP49429 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HpdP49429 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HpdP49429 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HpdP49429 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HpdP49429 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HpdP49429 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HpdP49429 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HpdP49429 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms