Protein–RNA interactions for Protein: P48787

Tnni3, Troponin I, cardiac muscle, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnni3P48787 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tnni3P48787 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tnni3P48787 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tnni3P48787 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Tnni3P48787 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Tnni3P48787 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tnni3P48787 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Tnni3P48787 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tnni3P48787 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tnni3P48787 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tnni3P48787 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tnni3P48787 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnni3P48787 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnni3P48787 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnni3P48787 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnni3P48787 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnni3P48787 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnni3P48787 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnni3P48787 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnni3P48787 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnni3P48787 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnni3P48787 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnni3P48787 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnni3P48787 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnni3P48787 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnni3P48787 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnni3P48787 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnni3P48787 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnni3P48787 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnni3P48787 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tnni3P48787 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tnni3P48787 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tnni3P48787 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tnni3P48787 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tnni3P48787 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tnni3P48787 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tnni3P48787 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tnni3P48787 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tnni3P48787 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tnni3P48787 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Tnni3P48787 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tnni3P48787 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tnni3P48787 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tnni3P48787 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tnni3P48787 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tnni3P48787 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tnni3P48787 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tnni3P48787 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tnni3P48787 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tnni3P48787 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tnni3P48787 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tnni3P48787 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnni3P48787 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnni3P48787 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnni3P48787 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnni3P48787 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnni3P48787 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnni3P48787 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnni3P48787 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnni3P48787 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnni3P48787 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnni3P48787 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnni3P48787 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnni3P48787 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnni3P48787 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnni3P48787 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnni3P48787 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnni3P48787 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnni3P48787 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnni3P48787 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnni3P48787 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnni3P48787 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnni3P48787 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnni3P48787 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnni3P48787 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnni3P48787 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnni3P48787 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnni3P48787 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnni3P48787 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnni3P48787 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnni3P48787 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnni3P48787 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnni3P48787 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnni3P48787 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnni3P48787 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnni3P48787 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnni3P48787 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnni3P48787 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnni3P48787 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnni3P48787 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnni3P48787 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnni3P48787 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnni3P48787 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnni3P48787 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnni3P48787 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnni3P48787 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnni3P48787 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnni3P48787 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnni3P48787 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnni3P48787 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms