Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VdrP48281 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
VdrP48281 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
VdrP48281 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VdrP48281 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VdrP48281 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VdrP48281 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VdrP48281 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VdrP48281 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VdrP48281 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VdrP48281 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VdrP48281 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VdrP48281 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VdrP48281 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VdrP48281 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VdrP48281 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VdrP48281 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
VdrP48281 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VdrP48281 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VdrP48281 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VdrP48281 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VdrP48281 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VdrP48281 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VdrP48281 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VdrP48281 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VdrP48281 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VdrP48281 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VdrP48281 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VdrP48281 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VdrP48281 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VdrP48281 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VdrP48281 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VdrP48281 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VdrP48281 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VdrP48281 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VdrP48281 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VdrP48281 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
VdrP48281 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
VdrP48281 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VdrP48281 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VdrP48281 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VdrP48281 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VdrP48281 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VdrP48281 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VdrP48281 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VdrP48281 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
VdrP48281 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
VdrP48281 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VdrP48281 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VdrP48281 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VdrP48281 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VdrP48281 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VdrP48281 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
VdrP48281 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VdrP48281 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VdrP48281 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VdrP48281 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VdrP48281 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VdrP48281 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VdrP48281 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VdrP48281 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VdrP48281 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VdrP48281 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VdrP48281 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VdrP48281 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VdrP48281 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VdrP48281 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VdrP48281 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VdrP48281 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VdrP48281 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VdrP48281 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VdrP48281 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VdrP48281 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VdrP48281 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
VdrP48281 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VdrP48281 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VdrP48281 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VdrP48281 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VdrP48281 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VdrP48281 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VdrP48281 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VdrP48281 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VdrP48281 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
VdrP48281 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VdrP48281 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VdrP48281 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VdrP48281 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VdrP48281 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VdrP48281 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VdrP48281 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VdrP48281 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VdrP48281 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VdrP48281 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VdrP48281 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VdrP48281 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VdrP48281 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
VdrP48281 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VdrP48281 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VdrP48281 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VdrP48281 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms