Protein–RNA interactions for Protein: P48030

Tgfa, Protransforming growth factor alpha, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TgfaP48030 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TgfaP48030 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TgfaP48030 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TgfaP48030 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TgfaP48030 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TgfaP48030 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TgfaP48030 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TgfaP48030 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TgfaP48030 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TgfaP48030 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
TgfaP48030 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TgfaP48030 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TgfaP48030 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TgfaP48030 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TgfaP48030 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TgfaP48030 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TgfaP48030 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TgfaP48030 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TgfaP48030 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TgfaP48030 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TgfaP48030 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TgfaP48030 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TgfaP48030 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TgfaP48030 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TgfaP48030 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TgfaP48030 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TgfaP48030 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TgfaP48030 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TgfaP48030 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TgfaP48030 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TgfaP48030 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TgfaP48030 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TgfaP48030 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TgfaP48030 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TgfaP48030 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TgfaP48030 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TgfaP48030 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TgfaP48030 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TgfaP48030 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TgfaP48030 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TgfaP48030 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TgfaP48030 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TgfaP48030 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TgfaP48030 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TgfaP48030 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TgfaP48030 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TgfaP48030 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TgfaP48030 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TgfaP48030 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TgfaP48030 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TgfaP48030 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TgfaP48030 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TgfaP48030 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TgfaP48030 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TgfaP48030 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TgfaP48030 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TgfaP48030 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TgfaP48030 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TgfaP48030 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TgfaP48030 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TgfaP48030 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TgfaP48030 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TgfaP48030 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TgfaP48030 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TgfaP48030 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TgfaP48030 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TgfaP48030 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TgfaP48030 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TgfaP48030 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TgfaP48030 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TgfaP48030 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TgfaP48030 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TgfaP48030 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TgfaP48030 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TgfaP48030 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TgfaP48030 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TgfaP48030 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TgfaP48030 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TgfaP48030 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TgfaP48030 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TgfaP48030 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TgfaP48030 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TgfaP48030 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TgfaP48030 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TgfaP48030 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TgfaP48030 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TgfaP48030 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TgfaP48030 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TgfaP48030 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TgfaP48030 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TgfaP48030 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TgfaP48030 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TgfaP48030 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
TgfaP48030 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TgfaP48030 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TgfaP48030 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TgfaP48030 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TgfaP48030 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TgfaP48030 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TgfaP48030 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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