Protein–RNA interactions for Protein: P43488

Tnfsf4, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 4, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf4P43488 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnfsf4P43488 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnfsf4P43488 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnfsf4P43488 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnfsf4P43488 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnfsf4P43488 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnfsf4P43488 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnfsf4P43488 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnfsf4P43488 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnfsf4P43488 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnfsf4P43488 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnfsf4P43488 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnfsf4P43488 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnfsf4P43488 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnfsf4P43488 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnfsf4P43488 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnfsf4P43488 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnfsf4P43488 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnfsf4P43488 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnfsf4P43488 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnfsf4P43488 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnfsf4P43488 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnfsf4P43488 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnfsf4P43488 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnfsf4P43488 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnfsf4P43488 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnfsf4P43488 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnfsf4P43488 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnfsf4P43488 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnfsf4P43488 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnfsf4P43488 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnfsf4P43488 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnfsf4P43488 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnfsf4P43488 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnfsf4P43488 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnfsf4P43488 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnfsf4P43488 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnfsf4P43488 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnfsf4P43488 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnfsf4P43488 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnfsf4P43488 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tnfsf4P43488 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tnfsf4P43488 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tnfsf4P43488 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tnfsf4P43488 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tnfsf4P43488 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tnfsf4P43488 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tnfsf4P43488 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Tnfsf4P43488 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Tnfsf4P43488 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tnfsf4P43488 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tnfsf4P43488 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Tnfsf4P43488 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tnfsf4P43488 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tnfsf4P43488 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tnfsf4P43488 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tnfsf4P43488 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tnfsf4P43488 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tnfsf4P43488 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnfsf4P43488 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnfsf4P43488 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnfsf4P43488 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnfsf4P43488 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnfsf4P43488 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnfsf4P43488 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnfsf4P43488 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnfsf4P43488 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnfsf4P43488 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnfsf4P43488 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnfsf4P43488 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnfsf4P43488 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnfsf4P43488 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnfsf4P43488 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnfsf4P43488 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnfsf4P43488 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnfsf4P43488 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnfsf4P43488 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnfsf4P43488 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnfsf4P43488 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnfsf4P43488 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnfsf4P43488 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnfsf4P43488 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnfsf4P43488 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnfsf4P43488 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnfsf4P43488 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnfsf4P43488 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnfsf4P43488 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnfsf4P43488 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnfsf4P43488 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnfsf4P43488 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnfsf4P43488 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnfsf4P43488 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnfsf4P43488 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnfsf4P43488 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnfsf4P43488 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnfsf4P43488 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnfsf4P43488 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnfsf4P43488 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnfsf4P43488 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnfsf4P43488 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms