Protein–RNA interactions for Protein: P41971

Elk3, ETS domain-containing protein Elk-3, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Elk3P41971 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Elk3P41971 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Elk3P41971 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Elk3P41971 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Elk3P41971 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Elk3P41971 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Elk3P41971 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Elk3P41971 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Elk3P41971 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Elk3P41971 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Elk3P41971 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Elk3P41971 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Elk3P41971 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Elk3P41971 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Elk3P41971 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Elk3P41971 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Elk3P41971 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Elk3P41971 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Elk3P41971 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Elk3P41971 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Elk3P41971 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Elk3P41971 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Elk3P41971 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Elk3P41971 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Elk3P41971 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Elk3P41971 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Elk3P41971 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Elk3P41971 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Elk3P41971 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Elk3P41971 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Elk3P41971 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Elk3P41971 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Elk3P41971 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Elk3P41971 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Elk3P41971 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Elk3P41971 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Elk3P41971 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Elk3P41971 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Elk3P41971 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Elk3P41971 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Elk3P41971 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Elk3P41971 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Elk3P41971 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Elk3P41971 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Elk3P41971 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Elk3P41971 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Elk3P41971 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Elk3P41971 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Elk3P41971 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Elk3P41971 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Elk3P41971 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Elk3P41971 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Elk3P41971 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Elk3P41971 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Elk3P41971 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Elk3P41971 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Elk3P41971 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Elk3P41971 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Elk3P41971 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Elk3P41971 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Elk3P41971 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Elk3P41971 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Elk3P41971 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Elk3P41971 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Elk3P41971 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Elk3P41971 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Elk3P41971 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Elk3P41971 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Elk3P41971 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Elk3P41971 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Elk3P41971 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Elk3P41971 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Elk3P41971 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Elk3P41971 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Elk3P41971 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Elk3P41971 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Elk3P41971 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Elk3P41971 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Elk3P41971 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Elk3P41971 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Elk3P41971 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Elk3P41971 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Elk3P41971 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Elk3P41971 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Elk3P41971 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Elk3P41971 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Elk3P41971 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Elk3P41971 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Elk3P41971 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Elk3P41971 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Elk3P41971 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Elk3P41971 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Elk3P41971 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Elk3P41971 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Elk3P41971 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Elk3P41971 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Elk3P41971 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Elk3P41971 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Elk3P41971 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Elk3P41971 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms