Protein–RNA interactions for Protein: P41274

Tnfsf9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf9P41274 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfsf9P41274 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfsf9P41274 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfsf9P41274 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfsf9P41274 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfsf9P41274 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfsf9P41274 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfsf9P41274 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfsf9P41274 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfsf9P41274 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfsf9P41274 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfsf9P41274 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfsf9P41274 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfsf9P41274 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfsf9P41274 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfsf9P41274 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfsf9P41274 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfsf9P41274 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfsf9P41274 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfsf9P41274 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfsf9P41274 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfsf9P41274 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfsf9P41274 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfsf9P41274 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfsf9P41274 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfsf9P41274 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfsf9P41274 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfsf9P41274 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfsf9P41274 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfsf9P41274 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfsf9P41274 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfsf9P41274 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfsf9P41274 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfsf9P41274 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfsf9P41274 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfsf9P41274 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfsf9P41274 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfsf9P41274 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfsf9P41274 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfsf9P41274 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfsf9P41274 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfsf9P41274 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfsf9P41274 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfsf9P41274 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfsf9P41274 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfsf9P41274 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfsf9P41274 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfsf9P41274 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfsf9P41274 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfsf9P41274 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfsf9P41274 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfsf9P41274 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfsf9P41274 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfsf9P41274 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfsf9P41274 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfsf9P41274 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfsf9P41274 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfsf9P41274 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfsf9P41274 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfsf9P41274 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfsf9P41274 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfsf9P41274 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfsf9P41274 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfsf9P41274 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfsf9P41274 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfsf9P41274 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfsf9P41274 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfsf9P41274 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfsf9P41274 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfsf9P41274 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfsf9P41274 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfsf9P41274 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfsf9P41274 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfsf9P41274 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfsf9P41274 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfsf9P41274 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfsf9P41274 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfsf9P41274 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfsf9P41274 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfsf9P41274 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfsf9P41274 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfsf9P41274 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfsf9P41274 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfsf9P41274 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfsf9P41274 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfsf9P41274 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfsf9P41274 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfsf9P41274 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfsf9P41274 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfsf9P41274 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfsf9P41274 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfsf9P41274 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfsf9P41274 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfsf9P41274 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfsf9P41274 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfsf9P41274 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfsf9P41274 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfsf9P41274 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnfsf9P41274 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnfsf9P41274 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms