Protein–RNA interactions for Protein: P40338

Vhl, von Hippel-Lindau disease tumor suppressor, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VhlP40338 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
VhlP40338 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
VhlP40338 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
VhlP40338 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
VhlP40338 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
VhlP40338 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
VhlP40338 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
VhlP40338 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
VhlP40338 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
VhlP40338 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
VhlP40338 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
VhlP40338 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
VhlP40338 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
VhlP40338 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
VhlP40338 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
VhlP40338 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
VhlP40338 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
VhlP40338 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
VhlP40338 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
VhlP40338 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
VhlP40338 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
VhlP40338 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
VhlP40338 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
VhlP40338 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
VhlP40338 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
VhlP40338 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
VhlP40338 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
VhlP40338 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
VhlP40338 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
VhlP40338 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
VhlP40338 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
VhlP40338 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
VhlP40338 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
VhlP40338 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
VhlP40338 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
VhlP40338 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
VhlP40338 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
VhlP40338 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
VhlP40338 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
VhlP40338 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
VhlP40338 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
VhlP40338 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
VhlP40338 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
VhlP40338 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
VhlP40338 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
VhlP40338 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
VhlP40338 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
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VhlP40338 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
VhlP40338 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
VhlP40338 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
VhlP40338 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
VhlP40338 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
VhlP40338 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
VhlP40338 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
VhlP40338 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
VhlP40338 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
VhlP40338 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
VhlP40338 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
VhlP40338 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
VhlP40338 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
VhlP40338 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
VhlP40338 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
VhlP40338 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
VhlP40338 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
VhlP40338 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
VhlP40338 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
VhlP40338 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
VhlP40338 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
VhlP40338 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
VhlP40338 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
VhlP40338 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
VhlP40338 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
VhlP40338 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
VhlP40338 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
VhlP40338 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
VhlP40338 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
VhlP40338 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
VhlP40338 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
VhlP40338 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
VhlP40338 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
VhlP40338 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
VhlP40338 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
VhlP40338 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
VhlP40338 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
VhlP40338 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
VhlP40338 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
VhlP40338 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
VhlP40338 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
VhlP40338 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
VhlP40338 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
VhlP40338 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
VhlP40338 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
VhlP40338 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
VhlP40338 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
VhlP40338 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
VhlP40338 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
VhlP40338 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
VhlP40338 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
VhlP40338 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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