Protein–RNA interactions for Protein: P40223

Csf3r, Granulocyte colony-stimulating factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csf3rP40223 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Csf3rP40223 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Csf3rP40223 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Csf3rP40223 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Csf3rP40223 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Csf3rP40223 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Csf3rP40223 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Csf3rP40223 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Csf3rP40223 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Csf3rP40223 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Csf3rP40223 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Csf3rP40223 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Csf3rP40223 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Csf3rP40223 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Csf3rP40223 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Csf3rP40223 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Csf3rP40223 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Csf3rP40223 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Csf3rP40223 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Csf3rP40223 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Csf3rP40223 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Csf3rP40223 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Csf3rP40223 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Csf3rP40223 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Csf3rP40223 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Csf3rP40223 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Csf3rP40223 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Csf3rP40223 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Csf3rP40223 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Csf3rP40223 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Csf3rP40223 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Csf3rP40223 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Csf3rP40223 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Csf3rP40223 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Csf3rP40223 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Csf3rP40223 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Csf3rP40223 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Csf3rP40223 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Csf3rP40223 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Csf3rP40223 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Csf3rP40223 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Csf3rP40223 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Csf3rP40223 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Csf3rP40223 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Csf3rP40223 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Csf3rP40223 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Csf3rP40223 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Csf3rP40223 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Csf3rP40223 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Csf3rP40223 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Csf3rP40223 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Csf3rP40223 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Csf3rP40223 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Csf3rP40223 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Csf3rP40223 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Csf3rP40223 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Csf3rP40223 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Csf3rP40223 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Csf3rP40223 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Csf3rP40223 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Csf3rP40223 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Csf3rP40223 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Csf3rP40223 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Csf3rP40223 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Csf3rP40223 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Csf3rP40223 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Csf3rP40223 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Csf3rP40223 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Csf3rP40223 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Csf3rP40223 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Csf3rP40223 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Csf3rP40223 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Csf3rP40223 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Csf3rP40223 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Csf3rP40223 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Csf3rP40223 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Csf3rP40223 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Csf3rP40223 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Csf3rP40223 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Csf3rP40223 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Csf3rP40223 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Csf3rP40223 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Csf3rP40223 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Csf3rP40223 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Csf3rP40223 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Csf3rP40223 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Csf3rP40223 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Csf3rP40223 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Csf3rP40223 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Csf3rP40223 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Csf3rP40223 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Csf3rP40223 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Csf3rP40223 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Csf3rP40223 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Csf3rP40223 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Csf3rP40223 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Csf3rP40223 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Csf3rP40223 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Csf3rP40223 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Csf3rP40223 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.7 ms