Protein–RNA interactions for Protein: P39447

Tjp1, Tight junction protein ZO-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tjp1P39447 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Tjp1P39447 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tjp1P39447 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tjp1P39447 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tjp1P39447 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tjp1P39447 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tjp1P39447 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tjp1P39447 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Tjp1P39447 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Tjp1P39447 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tjp1P39447 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tjp1P39447 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tjp1P39447 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tjp1P39447 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tjp1P39447 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tjp1P39447 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tjp1P39447 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Tjp1P39447 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tjp1P39447 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tjp1P39447 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tjp1P39447 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tjp1P39447 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tjp1P39447 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tjp1P39447 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tjp1P39447 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tjp1P39447 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tjp1P39447 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tjp1P39447 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tjp1P39447 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tjp1P39447 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Tjp1P39447 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tjp1P39447 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tjp1P39447 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tjp1P39447 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Tjp1P39447 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tjp1P39447 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tjp1P39447 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tjp1P39447 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tjp1P39447 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tjp1P39447 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tjp1P39447 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Tjp1P39447 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tjp1P39447 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tjp1P39447 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tjp1P39447 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tjp1P39447 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tjp1P39447 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tjp1P39447 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tjp1P39447 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tjp1P39447 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tjp1P39447 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tjp1P39447 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tjp1P39447 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Tjp1P39447 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tjp1P39447 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tjp1P39447 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tjp1P39447 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tjp1P39447 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tjp1P39447 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tjp1P39447 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tjp1P39447 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tjp1P39447 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Tjp1P39447 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tjp1P39447 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tjp1P39447 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Tjp1P39447 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tjp1P39447 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tjp1P39447 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tjp1P39447 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tjp1P39447 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Tjp1P39447 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tjp1P39447 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tjp1P39447 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tjp1P39447 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tjp1P39447 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tjp1P39447 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tjp1P39447 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tjp1P39447 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tjp1P39447 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tjp1P39447 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tjp1P39447 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Tjp1P39447 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tjp1P39447 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tjp1P39447 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tjp1P39447 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tjp1P39447 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tjp1P39447 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tjp1P39447 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tjp1P39447 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tjp1P39447 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tjp1P39447 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tjp1P39447 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tjp1P39447 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Tjp1P39447 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tjp1P39447 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tjp1P39447 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tjp1P39447 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tjp1P39447 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tjp1P39447 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tjp1P39447 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms