Protein–RNA interactions for Protein: P36993

Ppm1b, Protein phosphatase 1B, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppm1bP36993 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ppm1bP36993 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ppm1bP36993 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ppm1bP36993 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ppm1bP36993 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ppm1bP36993 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ppm1bP36993 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ppm1bP36993 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ppm1bP36993 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ppm1bP36993 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ppm1bP36993 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ppm1bP36993 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ppm1bP36993 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ppm1bP36993 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ppm1bP36993 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ppm1bP36993 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ppm1bP36993 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ppm1bP36993 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ppm1bP36993 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ppm1bP36993 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ppm1bP36993 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ppm1bP36993 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ppm1bP36993 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ppm1bP36993 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ppm1bP36993 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ppm1bP36993 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ppm1bP36993 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ppm1bP36993 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ppm1bP36993 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ppm1bP36993 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ppm1bP36993 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ppm1bP36993 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ppm1bP36993 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ppm1bP36993 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ppm1bP36993 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ppm1bP36993 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ppm1bP36993 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ppm1bP36993 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ppm1bP36993 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ppm1bP36993 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ppm1bP36993 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ppm1bP36993 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ppm1bP36993 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ppm1bP36993 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ppm1bP36993 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ppm1bP36993 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ppm1bP36993 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ppm1bP36993 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ppm1bP36993 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ppm1bP36993 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ppm1bP36993 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ppm1bP36993 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ppm1bP36993 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ppm1bP36993 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ppm1bP36993 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ppm1bP36993 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ppm1bP36993 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ppm1bP36993 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ppm1bP36993 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ppm1bP36993 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ppm1bP36993 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ppm1bP36993 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ppm1bP36993 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ppm1bP36993 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ppm1bP36993 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ppm1bP36993 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ppm1bP36993 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ppm1bP36993 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ppm1bP36993 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ppm1bP36993 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ppm1bP36993 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ppm1bP36993 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ppm1bP36993 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ppm1bP36993 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ppm1bP36993 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ppm1bP36993 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ppm1bP36993 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ppm1bP36993 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ppm1bP36993 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ppm1bP36993 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ppm1bP36993 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ppm1bP36993 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ppm1bP36993 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ppm1bP36993 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ppm1bP36993 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ppm1bP36993 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ppm1bP36993 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ppm1bP36993 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ppm1bP36993 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ppm1bP36993 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ppm1bP36993 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ppm1bP36993 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ppm1bP36993 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ppm1bP36993 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ppm1bP36993 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ppm1bP36993 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ppm1bP36993 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ppm1bP36993 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ppm1bP36993 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ppm1bP36993 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.5 ms