Protein–RNA interactions for Protein: P35436

Grin2a, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, mousemouse

Predictions only

Length 1,464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2aP35436 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Grin2aP35436 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Grin2aP35436 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Grin2aP35436 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Grin2aP35436 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Grin2aP35436 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Grin2aP35436 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Grin2aP35436 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Grin2aP35436 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Grin2aP35436 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Grin2aP35436 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Grin2aP35436 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Grin2aP35436 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Grin2aP35436 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Grin2aP35436 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Grin2aP35436 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Grin2aP35436 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Grin2aP35436 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Grin2aP35436 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Grin2aP35436 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Grin2aP35436 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Grin2aP35436 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Grin2aP35436 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Grin2aP35436 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Grin2aP35436 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Grin2aP35436 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Grin2aP35436 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Grin2aP35436 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Grin2aP35436 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Grin2aP35436 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Grin2aP35436 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Grin2aP35436 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Grin2aP35436 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Grin2aP35436 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Grin2aP35436 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Grin2aP35436 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Grin2aP35436 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Grin2aP35436 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Grin2aP35436 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Grin2aP35436 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Grin2aP35436 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Grin2aP35436 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Grin2aP35436 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Grin2aP35436 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Grin2aP35436 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Grin2aP35436 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Grin2aP35436 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Grin2aP35436 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Grin2aP35436 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Grin2aP35436 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Grin2aP35436 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Grin2aP35436 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Grin2aP35436 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Grin2aP35436 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Grin2aP35436 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Grin2aP35436 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Grin2aP35436 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Grin2aP35436 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Grin2aP35436 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Grin2aP35436 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Grin2aP35436 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Grin2aP35436 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Grin2aP35436 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Grin2aP35436 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Grin2aP35436 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Grin2aP35436 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Grin2aP35436 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Grin2aP35436 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Grin2aP35436 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Grin2aP35436 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Grin2aP35436 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Grin2aP35436 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Grin2aP35436 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Grin2aP35436 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Grin2aP35436 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Grin2aP35436 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Grin2aP35436 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Grin2aP35436 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Grin2aP35436 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Grin2aP35436 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Grin2aP35436 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Grin2aP35436 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Grin2aP35436 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Grin2aP35436 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Grin2aP35436 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Grin2aP35436 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Grin2aP35436 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Grin2aP35436 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Grin2aP35436 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Grin2aP35436 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Grin2aP35436 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Grin2aP35436 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Grin2aP35436 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Grin2aP35436 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Grin2aP35436 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Grin2aP35436 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Grin2aP35436 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Grin2aP35436 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Grin2aP35436 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Grin2aP35436 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms