Protein–RNA interactions for Protein: P34960

Mmp12, Macrophage metalloelastase, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp12P34960 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mmp12P34960 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mmp12P34960 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mmp12P34960 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mmp12P34960 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mmp12P34960 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mmp12P34960 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mmp12P34960 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mmp12P34960 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mmp12P34960 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mmp12P34960 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mmp12P34960 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Mmp12P34960 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mmp12P34960 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mmp12P34960 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mmp12P34960 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mmp12P34960 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mmp12P34960 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mmp12P34960 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mmp12P34960 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mmp12P34960 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mmp12P34960 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mmp12P34960 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mmp12P34960 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mmp12P34960 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mmp12P34960 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mmp12P34960 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mmp12P34960 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mmp12P34960 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mmp12P34960 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mmp12P34960 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mmp12P34960 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mmp12P34960 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mmp12P34960 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mmp12P34960 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mmp12P34960 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mmp12P34960 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mmp12P34960 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mmp12P34960 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mmp12P34960 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mmp12P34960 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mmp12P34960 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mmp12P34960 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mmp12P34960 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mmp12P34960 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mmp12P34960 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mmp12P34960 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mmp12P34960 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mmp12P34960 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mmp12P34960 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mmp12P34960 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mmp12P34960 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mmp12P34960 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mmp12P34960 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mmp12P34960 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mmp12P34960 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mmp12P34960 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mmp12P34960 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mmp12P34960 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mmp12P34960 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mmp12P34960 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mmp12P34960 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Mmp12P34960 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Mmp12P34960 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mmp12P34960 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mmp12P34960 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mmp12P34960 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mmp12P34960 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mmp12P34960 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mmp12P34960 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mmp12P34960 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mmp12P34960 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mmp12P34960 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mmp12P34960 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mmp12P34960 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mmp12P34960 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mmp12P34960 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mmp12P34960 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mmp12P34960 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mmp12P34960 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mmp12P34960 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mmp12P34960 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mmp12P34960 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mmp12P34960 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mmp12P34960 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Mmp12P34960 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mmp12P34960 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mmp12P34960 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mmp12P34960 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mmp12P34960 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Mmp12P34960 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mmp12P34960 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mmp12P34960 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mmp12P34960 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mmp12P34960 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Mmp12P34960 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mmp12P34960 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mmp12P34960 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mmp12P34960 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mmp12P34960 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73 ms