Protein–RNA interactions for Protein: P33611

Pola2, DNA polymerase alpha subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pola2P33611 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Pola2P33611 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Pola2P33611 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Pola2P33611 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Pola2P33611 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pola2P33611 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pola2P33611 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pola2P33611 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pola2P33611 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pola2P33611 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pola2P33611 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pola2P33611 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pola2P33611 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pola2P33611 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pola2P33611 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pola2P33611 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pola2P33611 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pola2P33611 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pola2P33611 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pola2P33611 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pola2P33611 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pola2P33611 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pola2P33611 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pola2P33611 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pola2P33611 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pola2P33611 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pola2P33611 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pola2P33611 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Pola2P33611 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pola2P33611 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pola2P33611 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pola2P33611 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pola2P33611 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Pola2P33611 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pola2P33611 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pola2P33611 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pola2P33611 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pola2P33611 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pola2P33611 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pola2P33611 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pola2P33611 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pola2P33611 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pola2P33611 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pola2P33611 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pola2P33611 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pola2P33611 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pola2P33611 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Pola2P33611 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pola2P33611 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pola2P33611 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Pola2P33611 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pola2P33611 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pola2P33611 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pola2P33611 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pola2P33611 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pola2P33611 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pola2P33611 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pola2P33611 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pola2P33611 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pola2P33611 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pola2P33611 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pola2P33611 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Pola2P33611 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pola2P33611 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pola2P33611 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pola2P33611 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pola2P33611 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pola2P33611 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pola2P33611 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pola2P33611 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pola2P33611 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pola2P33611 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pola2P33611 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pola2P33611 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pola2P33611 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pola2P33611 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pola2P33611 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pola2P33611 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pola2P33611 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pola2P33611 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pola2P33611 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pola2P33611 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pola2P33611 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pola2P33611 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pola2P33611 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Pola2P33611 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pola2P33611 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pola2P33611 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pola2P33611 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pola2P33611 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pola2P33611 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pola2P33611 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pola2P33611 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pola2P33611 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pola2P33611 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pola2P33611 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pola2P33611 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pola2P33611 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pola2P33611 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pola2P33611 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms