Protein–RNA interactions for Protein: P31041

Cd28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd28P31041 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Cd28P31041 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Cd28P31041 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cd28P31041 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cd28P31041 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Cd28P31041 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cd28P31041 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cd28P31041 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cd28P31041 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cd28P31041 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cd28P31041 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cd28P31041 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cd28P31041 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cd28P31041 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Cd28P31041 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Cd28P31041 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cd28P31041 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cd28P31041 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cd28P31041 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cd28P31041 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cd28P31041 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cd28P31041 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cd28P31041 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cd28P31041 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cd28P31041 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cd28P31041 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cd28P31041 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cd28P31041 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cd28P31041 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Cd28P31041 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cd28P31041 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cd28P31041 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cd28P31041 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cd28P31041 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cd28P31041 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cd28P31041 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cd28P31041 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cd28P31041 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cd28P31041 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cd28P31041 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cd28P31041 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cd28P31041 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cd28P31041 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Cd28P31041 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cd28P31041 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cd28P31041 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cd28P31041 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cd28P31041 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cd28P31041 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cd28P31041 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cd28P31041 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cd28P31041 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cd28P31041 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cd28P31041 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cd28P31041 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cd28P31041 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cd28P31041 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cd28P31041 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cd28P31041 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cd28P31041 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cd28P31041 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cd28P31041 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cd28P31041 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cd28P31041 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cd28P31041 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cd28P31041 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cd28P31041 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cd28P31041 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cd28P31041 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cd28P31041 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cd28P31041 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cd28P31041 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cd28P31041 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cd28P31041 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Cd28P31041 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cd28P31041 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cd28P31041 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cd28P31041 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cd28P31041 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cd28P31041 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cd28P31041 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cd28P31041 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cd28P31041 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cd28P31041 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cd28P31041 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cd28P31041 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cd28P31041 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cd28P31041 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cd28P31041 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Cd28P31041 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cd28P31041 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cd28P31041 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cd28P31041 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cd28P31041 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cd28P31041 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cd28P31041 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cd28P31041 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cd28P31041 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cd28P31041 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cd28P31041 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms