Protein–RNA interactions for Protein: P30548

Tacr1, Substance-P receptor, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tacr1P30548 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tacr1P30548 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Tacr1P30548 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tacr1P30548 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Tacr1P30548 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tacr1P30548 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tacr1P30548 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tacr1P30548 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tacr1P30548 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tacr1P30548 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tacr1P30548 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tacr1P30548 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tacr1P30548 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tacr1P30548 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Tacr1P30548 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tacr1P30548 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tacr1P30548 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tacr1P30548 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tacr1P30548 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tacr1P30548 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tacr1P30548 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tacr1P30548 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tacr1P30548 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tacr1P30548 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tacr1P30548 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tacr1P30548 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tacr1P30548 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tacr1P30548 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tacr1P30548 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tacr1P30548 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tacr1P30548 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tacr1P30548 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tacr1P30548 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tacr1P30548 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tacr1P30548 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tacr1P30548 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tacr1P30548 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tacr1P30548 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tacr1P30548 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tacr1P30548 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tacr1P30548 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tacr1P30548 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tacr1P30548 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tacr1P30548 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tacr1P30548 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tacr1P30548 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tacr1P30548 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tacr1P30548 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tacr1P30548 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tacr1P30548 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tacr1P30548 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tacr1P30548 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tacr1P30548 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Tacr1P30548 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tacr1P30548 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tacr1P30548 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tacr1P30548 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tacr1P30548 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tacr1P30548 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tacr1P30548 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tacr1P30548 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tacr1P30548 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tacr1P30548 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tacr1P30548 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tacr1P30548 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tacr1P30548 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tacr1P30548 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tacr1P30548 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Tacr1P30548 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Tacr1P30548 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tacr1P30548 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tacr1P30548 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Tacr1P30548 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tacr1P30548 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tacr1P30548 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tacr1P30548 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tacr1P30548 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tacr1P30548 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tacr1P30548 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tacr1P30548 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tacr1P30548 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tacr1P30548 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tacr1P30548 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tacr1P30548 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tacr1P30548 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tacr1P30548 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tacr1P30548 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tacr1P30548 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tacr1P30548 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tacr1P30548 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tacr1P30548 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tacr1P30548 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tacr1P30548 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tacr1P30548 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tacr1P30548 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tacr1P30548 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tacr1P30548 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tacr1P30548 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tacr1P30548 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Tacr1P30548 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms