Protein–RNA interactions for Protein: P29452

Casp1, Caspase-1, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp1P29452 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Casp1P29452 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Casp1P29452 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Casp1P29452 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Casp1P29452 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Casp1P29452 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Casp1P29452 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Casp1P29452 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Casp1P29452 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Casp1P29452 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Casp1P29452 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Casp1P29452 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Casp1P29452 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Casp1P29452 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Casp1P29452 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Casp1P29452 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Casp1P29452 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Casp1P29452 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Casp1P29452 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Casp1P29452 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Casp1P29452 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Casp1P29452 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Casp1P29452 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Casp1P29452 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Casp1P29452 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Casp1P29452 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Casp1P29452 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Casp1P29452 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Casp1P29452 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Casp1P29452 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Casp1P29452 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Casp1P29452 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Casp1P29452 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Casp1P29452 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Casp1P29452 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Casp1P29452 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Casp1P29452 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Casp1P29452 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Casp1P29452 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Casp1P29452 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Casp1P29452 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Casp1P29452 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Casp1P29452 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Casp1P29452 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Casp1P29452 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Casp1P29452 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Casp1P29452 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Casp1P29452 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Casp1P29452 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Casp1P29452 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Casp1P29452 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Casp1P29452 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Casp1P29452 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Casp1P29452 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Casp1P29452 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Casp1P29452 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Casp1P29452 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Casp1P29452 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Casp1P29452 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Casp1P29452 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Casp1P29452 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Casp1P29452 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Casp1P29452 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Casp1P29452 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Casp1P29452 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Casp1P29452 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Casp1P29452 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Casp1P29452 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Casp1P29452 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Casp1P29452 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Casp1P29452 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Casp1P29452 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Casp1P29452 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Casp1P29452 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Casp1P29452 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
Casp1P29452 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Casp1P29452 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Casp1P29452 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Casp1P29452 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Casp1P29452 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Casp1P29452 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Casp1P29452 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Casp1P29452 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Casp1P29452 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Casp1P29452 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Casp1P29452 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Casp1P29452 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Casp1P29452 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Casp1P29452 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Casp1P29452 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Casp1P29452 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Casp1P29452 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Casp1P29452 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Casp1P29452 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Casp1P29452 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Casp1P29452 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Casp1P29452 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Casp1P29452 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Casp1P29452 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Casp1P29452 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms