Protein–RNA interactions for Protein: P28867

Prkcd, Protein kinase C delta type, mousemouse

Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcdP28867 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PrkcdP28867 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PrkcdP28867 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PrkcdP28867 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PrkcdP28867 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PrkcdP28867 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PrkcdP28867 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PrkcdP28867 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PrkcdP28867 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PrkcdP28867 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PrkcdP28867 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PrkcdP28867 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PrkcdP28867 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PrkcdP28867 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PrkcdP28867 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PrkcdP28867 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PrkcdP28867 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PrkcdP28867 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PrkcdP28867 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PrkcdP28867 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PrkcdP28867 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PrkcdP28867 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PrkcdP28867 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PrkcdP28867 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PrkcdP28867 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PrkcdP28867 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PrkcdP28867 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PrkcdP28867 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PrkcdP28867 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PrkcdP28867 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PrkcdP28867 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PrkcdP28867 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PrkcdP28867 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PrkcdP28867 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PrkcdP28867 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PrkcdP28867 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PrkcdP28867 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PrkcdP28867 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PrkcdP28867 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PrkcdP28867 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PrkcdP28867 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PrkcdP28867 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PrkcdP28867 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PrkcdP28867 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PrkcdP28867 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PrkcdP28867 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PrkcdP28867 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PrkcdP28867 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PrkcdP28867 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PrkcdP28867 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PrkcdP28867 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PrkcdP28867 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PrkcdP28867 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PrkcdP28867 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PrkcdP28867 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PrkcdP28867 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PrkcdP28867 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PrkcdP28867 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PrkcdP28867 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PrkcdP28867 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PrkcdP28867 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PrkcdP28867 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PrkcdP28867 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PrkcdP28867 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PrkcdP28867 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PrkcdP28867 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PrkcdP28867 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PrkcdP28867 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PrkcdP28867 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PrkcdP28867 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PrkcdP28867 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PrkcdP28867 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PrkcdP28867 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PrkcdP28867 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PrkcdP28867 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PrkcdP28867 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PrkcdP28867 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PrkcdP28867 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PrkcdP28867 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PrkcdP28867 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PrkcdP28867 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PrkcdP28867 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PrkcdP28867 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PrkcdP28867 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PrkcdP28867 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PrkcdP28867 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PrkcdP28867 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PrkcdP28867 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PrkcdP28867 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PrkcdP28867 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PrkcdP28867 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PrkcdP28867 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PrkcdP28867 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PrkcdP28867 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PrkcdP28867 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PrkcdP28867 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PrkcdP28867 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PrkcdP28867 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PrkcdP28867 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PrkcdP28867 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms