Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hoxd10P28359 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hoxd10P28359 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hoxd10P28359 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hoxd10P28359 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hoxd10P28359 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hoxd10P28359 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hoxd10P28359 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hoxd10P28359 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hoxd10P28359 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hoxd10P28359 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hoxd10P28359 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hoxd10P28359 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hoxd10P28359 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Hoxd10P28359 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hoxd10P28359 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hoxd10P28359 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Hoxd10P28359 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hoxd10P28359 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hoxd10P28359 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hoxd10P28359 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hoxd10P28359 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hoxd10P28359 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hoxd10P28359 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hoxd10P28359 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hoxd10P28359 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hoxd10P28359 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hoxd10P28359 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hoxd10P28359 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hoxd10P28359 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hoxd10P28359 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hoxd10P28359 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hoxd10P28359 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hoxd10P28359 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hoxd10P28359 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hoxd10P28359 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hoxd10P28359 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hoxd10P28359 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hoxd10P28359 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hoxd10P28359 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hoxd10P28359 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hoxd10P28359 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hoxd10P28359 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hoxd10P28359 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hoxd10P28359 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hoxd10P28359 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Hoxd10P28359 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Hoxd10P28359 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Hoxd10P28359 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Hoxd10P28359 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Hoxd10P28359 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
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Hoxd10P28359 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Hoxd10P28359 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Hoxd10P28359 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Hoxd10P28359 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Hoxd10P28359 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Hoxd10P28359 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
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Hoxd10P28359 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hoxd10P28359 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
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Hoxd10P28359 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hoxd10P28359 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hoxd10P28359 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hoxd10P28359 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hoxd10P28359 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hoxd10P28359 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hoxd10P28359 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hoxd10P28359 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Hoxd10P28359 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hoxd10P28359 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hoxd10P28359 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hoxd10P28359 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hoxd10P28359 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxd10P28359 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxd10P28359 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxd10P28359 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxd10P28359 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxd10P28359 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxd10P28359 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxd10P28359 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxd10P28359 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxd10P28359 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxd10P28359 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxd10P28359 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxd10P28359 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxd10P28359 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxd10P28359 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxd10P28359 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
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