Protein–RNA interactions for Protein: P28352

Apex1, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apex1P28352 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Apex1P28352 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Apex1P28352 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Apex1P28352 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Apex1P28352 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Apex1P28352 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apex1P28352 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apex1P28352 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apex1P28352 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apex1P28352 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apex1P28352 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apex1P28352 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apex1P28352 Gm11434-201ENSMUST00000122379 629 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Apex1P28352 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apex1P28352 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apex1P28352 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apex1P28352 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apex1P28352 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apex1P28352 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apex1P28352 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apex1P28352 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apex1P28352 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Apex1P28352 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apex1P28352 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apex1P28352 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apex1P28352 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apex1P28352 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apex1P28352 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apex1P28352 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Apex1P28352 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apex1P28352 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apex1P28352 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apex1P28352 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apex1P28352 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apex1P28352 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apex1P28352 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apex1P28352 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apex1P28352 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apex1P28352 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apex1P28352 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apex1P28352 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apex1P28352 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apex1P28352 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apex1P28352 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apex1P28352 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apex1P28352 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apex1P28352 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Apex1P28352 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Apex1P28352 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Apex1P28352 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apex1P28352 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apex1P28352 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apex1P28352 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apex1P28352 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apex1P28352 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apex1P28352 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apex1P28352 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apex1P28352 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apex1P28352 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apex1P28352 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apex1P28352 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apex1P28352 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Apex1P28352 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Apex1P28352 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Apex1P28352 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Apex1P28352 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Apex1P28352 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Apex1P28352 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Apex1P28352 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Apex1P28352 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Apex1P28352 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Apex1P28352 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Apex1P28352 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Apex1P28352 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Apex1P28352 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Apex1P28352 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Apex1P28352 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Apex1P28352 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Apex1P28352 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Apex1P28352 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Apex1P28352 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Apex1P28352 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Apex1P28352 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Apex1P28352 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Apex1P28352 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Apex1P28352 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Apex1P28352 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Apex1P28352 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Apex1P28352 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Apex1P28352 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Apex1P28352 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Apex1P28352 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Apex1P28352 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Apex1P28352 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Apex1P28352 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Apex1P28352 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Apex1P28352 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Apex1P28352 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Apex1P28352 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Apex1P28352 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms