Protein–RNA interactions for Protein: P28322

Etv4, ETS translocation variant 4, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Etv4P28322 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Etv4P28322 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Etv4P28322 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Etv4P28322 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Etv4P28322 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Etv4P28322 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Etv4P28322 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Etv4P28322 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Etv4P28322 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Etv4P28322 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Etv4P28322 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Etv4P28322 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Etv4P28322 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Etv4P28322 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Etv4P28322 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Etv4P28322 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Etv4P28322 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Etv4P28322 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Etv4P28322 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Etv4P28322 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Etv4P28322 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Etv4P28322 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Etv4P28322 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Etv4P28322 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Etv4P28322 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Etv4P28322 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Etv4P28322 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Etv4P28322 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Etv4P28322 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Etv4P28322 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Etv4P28322 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Etv4P28322 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Etv4P28322 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Etv4P28322 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Etv4P28322 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Etv4P28322 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Etv4P28322 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Etv4P28322 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Etv4P28322 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Etv4P28322 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Etv4P28322 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Etv4P28322 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Etv4P28322 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Etv4P28322 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Etv4P28322 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Etv4P28322 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Etv4P28322 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Etv4P28322 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Etv4P28322 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Etv4P28322 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Etv4P28322 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Etv4P28322 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Etv4P28322 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Etv4P28322 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Etv4P28322 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Etv4P28322 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Etv4P28322 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Etv4P28322 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Etv4P28322 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Etv4P28322 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Etv4P28322 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Etv4P28322 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Etv4P28322 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Etv4P28322 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Etv4P28322 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Etv4P28322 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Etv4P28322 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Etv4P28322 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Etv4P28322 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Etv4P28322 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Etv4P28322 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Etv4P28322 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Etv4P28322 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Etv4P28322 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Etv4P28322 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Etv4P28322 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Etv4P28322 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Etv4P28322 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Etv4P28322 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Etv4P28322 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Etv4P28322 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Etv4P28322 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Etv4P28322 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Etv4P28322 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Etv4P28322 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Etv4P28322 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Etv4P28322 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Etv4P28322 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Etv4P28322 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Etv4P28322 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Etv4P28322 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Etv4P28322 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Etv4P28322 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Etv4P28322 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Etv4P28322 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Etv4P28322 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Etv4P28322 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Etv4P28322 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Etv4P28322 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Etv4P28322 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms