Protein–RNA interactions for Protein: P28231

Gjb3, Gap junction beta-3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb3P28231 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gjb3P28231 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gjb3P28231 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gjb3P28231 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gjb3P28231 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gjb3P28231 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gjb3P28231 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Gjb3P28231 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gjb3P28231 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gjb3P28231 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gjb3P28231 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gjb3P28231 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gjb3P28231 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gjb3P28231 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gjb3P28231 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gjb3P28231 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gjb3P28231 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gjb3P28231 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gjb3P28231 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Gjb3P28231 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gjb3P28231 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gjb3P28231 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gjb3P28231 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gjb3P28231 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Gjb3P28231 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gjb3P28231 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gjb3P28231 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gjb3P28231 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gjb3P28231 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gjb3P28231 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Gjb3P28231 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gjb3P28231 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gjb3P28231 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gjb3P28231 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gjb3P28231 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gjb3P28231 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gjb3P28231 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gjb3P28231 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gjb3P28231 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gjb3P28231 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gjb3P28231 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gjb3P28231 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gjb3P28231 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gjb3P28231 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gjb3P28231 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gjb3P28231 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gjb3P28231 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gjb3P28231 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gjb3P28231 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gjb3P28231 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gjb3P28231 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gjb3P28231 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gjb3P28231 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gjb3P28231 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gjb3P28231 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gjb3P28231 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gjb3P28231 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gjb3P28231 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gjb3P28231 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gjb3P28231 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gjb3P28231 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gjb3P28231 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gjb3P28231 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gjb3P28231 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gjb3P28231 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gjb3P28231 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gjb3P28231 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gjb3P28231 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gjb3P28231 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Gjb3P28231 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Gjb3P28231 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gjb3P28231 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gjb3P28231 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gjb3P28231 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gjb3P28231 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gjb3P28231 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gjb3P28231 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Gjb3P28231 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Gjb3P28231 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gjb3P28231 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gjb3P28231 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gjb3P28231 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gjb3P28231 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gjb3P28231 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gjb3P28231 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gjb3P28231 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gjb3P28231 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gjb3P28231 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gjb3P28231 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gjb3P28231 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gjb3P28231 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gjb3P28231 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gjb3P28231 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gjb3P28231 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Gjb3P28231 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gjb3P28231 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gjb3P28231 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gjb3P28231 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gjb3P28231 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gjb3P28231 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms