Protein–RNA interactions for Protein: P28230

Gjb1, Gap junction beta-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb1P28230 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gjb1P28230 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gjb1P28230 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gjb1P28230 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gjb1P28230 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gjb1P28230 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gjb1P28230 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gjb1P28230 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gjb1P28230 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gjb1P28230 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gjb1P28230 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gjb1P28230 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Gjb1P28230 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gjb1P28230 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gjb1P28230 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gjb1P28230 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gjb1P28230 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Gjb1P28230 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gjb1P28230 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Gjb1P28230 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gjb1P28230 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gjb1P28230 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gjb1P28230 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gjb1P28230 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Gjb1P28230 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Gjb1P28230 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Gjb1P28230 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Gjb1P28230 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Gjb1P28230 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Gjb1P28230 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Gjb1P28230 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Gjb1P28230 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gjb1P28230 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gjb1P28230 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gjb1P28230 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gjb1P28230 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gjb1P28230 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gjb1P28230 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gjb1P28230 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gjb1P28230 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gjb1P28230 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gjb1P28230 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gjb1P28230 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gjb1P28230 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gjb1P28230 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gjb1P28230 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gjb1P28230 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gjb1P28230 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gjb1P28230 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gjb1P28230 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gjb1P28230 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gjb1P28230 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gjb1P28230 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gjb1P28230 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gjb1P28230 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gjb1P28230 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gjb1P28230 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gjb1P28230 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gjb1P28230 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gjb1P28230 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gjb1P28230 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gjb1P28230 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gjb1P28230 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gjb1P28230 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gjb1P28230 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gjb1P28230 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gjb1P28230 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gjb1P28230 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gjb1P28230 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gjb1P28230 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gjb1P28230 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gjb1P28230 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gjb1P28230 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gjb1P28230 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gjb1P28230 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gjb1P28230 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gjb1P28230 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gjb1P28230 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gjb1P28230 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gjb1P28230 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gjb1P28230 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gjb1P28230 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gjb1P28230 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gjb1P28230 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gjb1P28230 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gjb1P28230 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gjb1P28230 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gjb1P28230 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gjb1P28230 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gjb1P28230 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Gjb1P28230 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gjb1P28230 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gjb1P28230 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gjb1P28230 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gjb1P28230 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gjb1P28230 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gjb1P28230 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gjb1P28230 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gjb1P28230 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gjb1P28230 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms