Protein–RNA interactions for Protein: P28076

Psmb9, Proteasome subunit beta type-9, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb9P28076 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Psmb9P28076 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Psmb9P28076 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Psmb9P28076 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Psmb9P28076 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Psmb9P28076 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Psmb9P28076 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Psmb9P28076 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Psmb9P28076 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Psmb9P28076 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Psmb9P28076 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Psmb9P28076 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Psmb9P28076 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Psmb9P28076 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Psmb9P28076 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Psmb9P28076 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Psmb9P28076 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Psmb9P28076 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Psmb9P28076 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Psmb9P28076 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Psmb9P28076 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Psmb9P28076 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Psmb9P28076 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Psmb9P28076 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Psmb9P28076 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Psmb9P28076 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Psmb9P28076 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Psmb9P28076 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Psmb9P28076 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Psmb9P28076 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Psmb9P28076 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Psmb9P28076 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Psmb9P28076 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Psmb9P28076 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Psmb9P28076 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Psmb9P28076 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Psmb9P28076 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Psmb9P28076 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Psmb9P28076 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Psmb9P28076 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Psmb9P28076 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Psmb9P28076 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Psmb9P28076 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Psmb9P28076 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Psmb9P28076 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Psmb9P28076 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Psmb9P28076 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Psmb9P28076 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Psmb9P28076 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Psmb9P28076 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Psmb9P28076 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Psmb9P28076 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Psmb9P28076 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Psmb9P28076 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Psmb9P28076 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Psmb9P28076 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Psmb9P28076 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Psmb9P28076 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Psmb9P28076 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Psmb9P28076 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Psmb9P28076 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Psmb9P28076 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Psmb9P28076 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Psmb9P28076 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Psmb9P28076 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Psmb9P28076 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Psmb9P28076 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Psmb9P28076 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Psmb9P28076 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Psmb9P28076 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Psmb9P28076 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Psmb9P28076 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Psmb9P28076 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Psmb9P28076 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Psmb9P28076 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Psmb9P28076 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Psmb9P28076 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Psmb9P28076 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Psmb9P28076 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Psmb9P28076 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Psmb9P28076 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Psmb9P28076 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Psmb9P28076 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Psmb9P28076 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Psmb9P28076 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Psmb9P28076 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Psmb9P28076 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Psmb9P28076 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Psmb9P28076 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Psmb9P28076 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Psmb9P28076 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Psmb9P28076 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Psmb9P28076 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Psmb9P28076 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Psmb9P28076 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Psmb9P28076 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Psmb9P28076 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Psmb9P28076 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Psmb9P28076 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Psmb9P28076 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms