Protein–RNA interactions for Protein: P27790

Cenpb, Major centromere autoantigen B, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpbP27790 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CenpbP27790 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CenpbP27790 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CenpbP27790 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CenpbP27790 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CenpbP27790 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CenpbP27790 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CenpbP27790 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CenpbP27790 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CenpbP27790 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CenpbP27790 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CenpbP27790 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CenpbP27790 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CenpbP27790 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CenpbP27790 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CenpbP27790 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CenpbP27790 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CenpbP27790 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CenpbP27790 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CenpbP27790 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CenpbP27790 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CenpbP27790 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CenpbP27790 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CenpbP27790 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CenpbP27790 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CenpbP27790 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CenpbP27790 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CenpbP27790 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CenpbP27790 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CenpbP27790 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CenpbP27790 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CenpbP27790 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CenpbP27790 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CenpbP27790 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CenpbP27790 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CenpbP27790 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CenpbP27790 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CenpbP27790 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CenpbP27790 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CenpbP27790 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CenpbP27790 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CenpbP27790 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CenpbP27790 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CenpbP27790 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CenpbP27790 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CenpbP27790 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CenpbP27790 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CenpbP27790 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CenpbP27790 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CenpbP27790 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CenpbP27790 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CenpbP27790 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CenpbP27790 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CenpbP27790 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CenpbP27790 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CenpbP27790 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CenpbP27790 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CenpbP27790 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CenpbP27790 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CenpbP27790 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CenpbP27790 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CenpbP27790 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CenpbP27790 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CenpbP27790 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CenpbP27790 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CenpbP27790 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CenpbP27790 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CenpbP27790 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CenpbP27790 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CenpbP27790 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CenpbP27790 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CenpbP27790 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CenpbP27790 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CenpbP27790 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CenpbP27790 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CenpbP27790 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CenpbP27790 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CenpbP27790 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CenpbP27790 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CenpbP27790 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CenpbP27790 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CenpbP27790 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CenpbP27790 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CenpbP27790 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CenpbP27790 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CenpbP27790 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CenpbP27790 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CenpbP27790 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CenpbP27790 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CenpbP27790 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CenpbP27790 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CenpbP27790 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CenpbP27790 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CenpbP27790 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CenpbP27790 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CenpbP27790 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CenpbP27790 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CenpbP27790 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CenpbP27790 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CenpbP27790 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms