Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PdgfraP26618 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PdgfraP26618 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PdgfraP26618 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PdgfraP26618 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PdgfraP26618 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
PdgfraP26618 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PdgfraP26618 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PdgfraP26618 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PdgfraP26618 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PdgfraP26618 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PdgfraP26618 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PdgfraP26618 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PdgfraP26618 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PdgfraP26618 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PdgfraP26618 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PdgfraP26618 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PdgfraP26618 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PdgfraP26618 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PdgfraP26618 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PdgfraP26618 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PdgfraP26618 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PdgfraP26618 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PdgfraP26618 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PdgfraP26618 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PdgfraP26618 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PdgfraP26618 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PdgfraP26618 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PdgfraP26618 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PdgfraP26618 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PdgfraP26618 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PdgfraP26618 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PdgfraP26618 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PdgfraP26618 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PdgfraP26618 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
PdgfraP26618 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PdgfraP26618 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PdgfraP26618 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PdgfraP26618 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PdgfraP26618 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PdgfraP26618 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PdgfraP26618 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PdgfraP26618 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PdgfraP26618 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PdgfraP26618 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PdgfraP26618 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PdgfraP26618 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PdgfraP26618 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PdgfraP26618 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PdgfraP26618 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PdgfraP26618 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PdgfraP26618 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PdgfraP26618 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PdgfraP26618 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PdgfraP26618 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PdgfraP26618 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PdgfraP26618 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PdgfraP26618 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PdgfraP26618 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PdgfraP26618 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PdgfraP26618 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PdgfraP26618 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PdgfraP26618 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PdgfraP26618 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PdgfraP26618 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PdgfraP26618 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PdgfraP26618 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PdgfraP26618 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PdgfraP26618 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PdgfraP26618 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PdgfraP26618 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PdgfraP26618 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PdgfraP26618 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PdgfraP26618 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PdgfraP26618 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PdgfraP26618 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PdgfraP26618 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PdgfraP26618 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PdgfraP26618 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PdgfraP26618 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PdgfraP26618 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PdgfraP26618 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PdgfraP26618 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PdgfraP26618 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PdgfraP26618 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
PdgfraP26618 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PdgfraP26618 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
PdgfraP26618 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PdgfraP26618 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PdgfraP26618 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PdgfraP26618 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PdgfraP26618 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PdgfraP26618 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PdgfraP26618 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PdgfraP26618 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PdgfraP26618 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
PdgfraP26618 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PdgfraP26618 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PdgfraP26618 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PdgfraP26618 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms