Protein–RNA interactions for Protein: P25425

Pou2f1, POU domain, class 2, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 770 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou2f1P25425 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Pou2f1P25425 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Pou2f1P25425 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pou2f1P25425 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pou2f1P25425 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pou2f1P25425 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pou2f1P25425 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pou2f1P25425 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pou2f1P25425 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pou2f1P25425 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pou2f1P25425 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pou2f1P25425 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pou2f1P25425 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pou2f1P25425 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Pou2f1P25425 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pou2f1P25425 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pou2f1P25425 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pou2f1P25425 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pou2f1P25425 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pou2f1P25425 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pou2f1P25425 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pou2f1P25425 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pou2f1P25425 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pou2f1P25425 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pou2f1P25425 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pou2f1P25425 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pou2f1P25425 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pou2f1P25425 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pou2f1P25425 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pou2f1P25425 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Pou2f1P25425 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pou2f1P25425 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pou2f1P25425 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pou2f1P25425 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pou2f1P25425 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pou2f1P25425 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pou2f1P25425 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pou2f1P25425 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pou2f1P25425 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pou2f1P25425 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pou2f1P25425 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pou2f1P25425 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pou2f1P25425 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pou2f1P25425 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pou2f1P25425 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pou2f1P25425 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pou2f1P25425 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pou2f1P25425 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Pou2f1P25425 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pou2f1P25425 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pou2f1P25425 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pou2f1P25425 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Pou2f1P25425 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pou2f1P25425 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pou2f1P25425 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pou2f1P25425 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pou2f1P25425 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Pou2f1P25425 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pou2f1P25425 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pou2f1P25425 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pou2f1P25425 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Pou2f1P25425 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pou2f1P25425 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pou2f1P25425 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pou2f1P25425 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pou2f1P25425 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pou2f1P25425 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pou2f1P25425 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pou2f1P25425 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pou2f1P25425 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pou2f1P25425 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pou2f1P25425 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pou2f1P25425 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pou2f1P25425 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pou2f1P25425 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pou2f1P25425 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pou2f1P25425 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pou2f1P25425 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pou2f1P25425 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pou2f1P25425 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pou2f1P25425 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pou2f1P25425 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pou2f1P25425 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pou2f1P25425 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pou2f1P25425 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pou2f1P25425 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pou2f1P25425 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pou2f1P25425 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pou2f1P25425 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pou2f1P25425 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pou2f1P25425 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pou2f1P25425 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pou2f1P25425 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pou2f1P25425 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pou2f1P25425 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pou2f1P25425 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pou2f1P25425 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pou2f1P25425 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pou2f1P25425 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pou2f1P25425 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms