Protein–RNA interactions for Protein: P25322

Ccnd1, G1/S-specific cyclin-D1, mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnd1P25322 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccnd1P25322 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccnd1P25322 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccnd1P25322 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccnd1P25322 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccnd1P25322 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccnd1P25322 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccnd1P25322 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccnd1P25322 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccnd1P25322 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccnd1P25322 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccnd1P25322 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccnd1P25322 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccnd1P25322 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccnd1P25322 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccnd1P25322 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccnd1P25322 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccnd1P25322 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccnd1P25322 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccnd1P25322 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccnd1P25322 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccnd1P25322 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccnd1P25322 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccnd1P25322 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccnd1P25322 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccnd1P25322 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccnd1P25322 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccnd1P25322 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccnd1P25322 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccnd1P25322 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccnd1P25322 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccnd1P25322 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccnd1P25322 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccnd1P25322 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccnd1P25322 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccnd1P25322 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccnd1P25322 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccnd1P25322 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccnd1P25322 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccnd1P25322 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccnd1P25322 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccnd1P25322 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccnd1P25322 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccnd1P25322 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccnd1P25322 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccnd1P25322 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccnd1P25322 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccnd1P25322 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccnd1P25322 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccnd1P25322 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccnd1P25322 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccnd1P25322 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccnd1P25322 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccnd1P25322 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccnd1P25322 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccnd1P25322 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccnd1P25322 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccnd1P25322 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccnd1P25322 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccnd1P25322 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccnd1P25322 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccnd1P25322 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccnd1P25322 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccnd1P25322 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccnd1P25322 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccnd1P25322 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccnd1P25322 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccnd1P25322 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccnd1P25322 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccnd1P25322 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccnd1P25322 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccnd1P25322 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccnd1P25322 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccnd1P25322 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccnd1P25322 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccnd1P25322 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccnd1P25322 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccnd1P25322 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccnd1P25322 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccnd1P25322 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccnd1P25322 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccnd1P25322 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccnd1P25322 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccnd1P25322 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccnd1P25322 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccnd1P25322 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccnd1P25322 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccnd1P25322 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccnd1P25322 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccnd1P25322 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccnd1P25322 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccnd1P25322 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccnd1P25322 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccnd1P25322 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccnd1P25322 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccnd1P25322 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccnd1P25322 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccnd1P25322 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccnd1P25322 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccnd1P25322 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms