Protein–RNA interactions for Protein: P25233

Ndn, Necdin, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NdnP25233 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NdnP25233 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NdnP25233 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NdnP25233 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NdnP25233 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NdnP25233 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NdnP25233 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NdnP25233 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NdnP25233 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NdnP25233 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NdnP25233 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NdnP25233 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NdnP25233 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NdnP25233 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NdnP25233 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NdnP25233 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NdnP25233 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NdnP25233 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NdnP25233 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NdnP25233 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
NdnP25233 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NdnP25233 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NdnP25233 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NdnP25233 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NdnP25233 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
NdnP25233 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
NdnP25233 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NdnP25233 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NdnP25233 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
NdnP25233 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NdnP25233 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
NdnP25233 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NdnP25233 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
NdnP25233 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
NdnP25233 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NdnP25233 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NdnP25233 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NdnP25233 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NdnP25233 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NdnP25233 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NdnP25233 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NdnP25233 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NdnP25233 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
NdnP25233 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
NdnP25233 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NdnP25233 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NdnP25233 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
NdnP25233 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NdnP25233 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NdnP25233 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NdnP25233 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NdnP25233 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NdnP25233 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NdnP25233 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
NdnP25233 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NdnP25233 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NdnP25233 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NdnP25233 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NdnP25233 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NdnP25233 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NdnP25233 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
NdnP25233 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NdnP25233 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NdnP25233 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
NdnP25233 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
NdnP25233 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NdnP25233 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NdnP25233 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NdnP25233 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NdnP25233 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NdnP25233 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NdnP25233 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NdnP25233 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NdnP25233 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NdnP25233 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NdnP25233 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NdnP25233 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NdnP25233 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NdnP25233 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
NdnP25233 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
NdnP25233 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
NdnP25233 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NdnP25233 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NdnP25233 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NdnP25233 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NdnP25233 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
NdnP25233 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
NdnP25233 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NdnP25233 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NdnP25233 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NdnP25233 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NdnP25233 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NdnP25233 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NdnP25233 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NdnP25233 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NdnP25233 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NdnP25233 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NdnP25233 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
NdnP25233 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NdnP25233 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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