Protein–RNA interactions for Protein: P24161

Cd247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, mousemouse

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd247P24161 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cd247P24161 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cd247P24161 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cd247P24161 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cd247P24161 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cd247P24161 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cd247P24161 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cd247P24161 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cd247P24161 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cd247P24161 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cd247P24161 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cd247P24161 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cd247P24161 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cd247P24161 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cd247P24161 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cd247P24161 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cd247P24161 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cd247P24161 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cd247P24161 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cd247P24161 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cd247P24161 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cd247P24161 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Cd247P24161 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cd247P24161 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cd247P24161 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cd247P24161 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Cd247P24161 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cd247P24161 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cd247P24161 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cd247P24161 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cd247P24161 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cd247P24161 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cd247P24161 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cd247P24161 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cd247P24161 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cd247P24161 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cd247P24161 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cd247P24161 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Cd247P24161 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Cd247P24161 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cd247P24161 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cd247P24161 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Cd247P24161 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cd247P24161 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cd247P24161 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cd247P24161 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cd247P24161 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cd247P24161 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cd247P24161 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cd247P24161 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cd247P24161 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cd247P24161 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cd247P24161 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cd247P24161 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cd247P24161 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cd247P24161 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cd247P24161 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cd247P24161 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cd247P24161 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cd247P24161 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cd247P24161 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cd247P24161 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cd247P24161 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cd247P24161 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cd247P24161 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cd247P24161 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cd247P24161 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cd247P24161 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cd247P24161 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cd247P24161 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Cd247P24161 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cd247P24161 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cd247P24161 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cd247P24161 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cd247P24161 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cd247P24161 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cd247P24161 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cd247P24161 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cd247P24161 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cd247P24161 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Cd247P24161 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Cd247P24161 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cd247P24161 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cd247P24161 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cd247P24161 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cd247P24161 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cd247P24161 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cd247P24161 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cd247P24161 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cd247P24161 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cd247P24161 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cd247P24161 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cd247P24161 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cd247P24161 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cd247P24161 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cd247P24161 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cd247P24161 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cd247P24161 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Cd247P24161 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cd247P24161 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms