Protein–RNA interactions for Protein: P23818

Gria1, Glutamate receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gria1P23818 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gria1P23818 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gria1P23818 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gria1P23818 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gria1P23818 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gria1P23818 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gria1P23818 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gria1P23818 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gria1P23818 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gria1P23818 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gria1P23818 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gria1P23818 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Gria1P23818 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gria1P23818 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gria1P23818 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gria1P23818 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gria1P23818 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gria1P23818 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gria1P23818 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gria1P23818 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gria1P23818 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gria1P23818 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gria1P23818 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gria1P23818 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gria1P23818 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gria1P23818 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gria1P23818 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gria1P23818 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gria1P23818 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gria1P23818 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gria1P23818 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gria1P23818 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gria1P23818 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gria1P23818 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gria1P23818 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gria1P23818 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gria1P23818 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gria1P23818 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gria1P23818 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gria1P23818 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gria1P23818 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gria1P23818 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gria1P23818 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gria1P23818 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gria1P23818 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gria1P23818 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gria1P23818 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Gria1P23818 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gria1P23818 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gria1P23818 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gria1P23818 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gria1P23818 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gria1P23818 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gria1P23818 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gria1P23818 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gria1P23818 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gria1P23818 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gria1P23818 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gria1P23818 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gria1P23818 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gria1P23818 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gria1P23818 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gria1P23818 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gria1P23818 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gria1P23818 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gria1P23818 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gria1P23818 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gria1P23818 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gria1P23818 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gria1P23818 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gria1P23818 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gria1P23818 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gria1P23818 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gria1P23818 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gria1P23818 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gria1P23818 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gria1P23818 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gria1P23818 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gria1P23818 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gria1P23818 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gria1P23818 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gria1P23818 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gria1P23818 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gria1P23818 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gria1P23818 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gria1P23818 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gria1P23818 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gria1P23818 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gria1P23818 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gria1P23818 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gria1P23818 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gria1P23818 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gria1P23818 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gria1P23818 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gria1P23818 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gria1P23818 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gria1P23818 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gria1P23818 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gria1P23818 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Gria1P23818 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms