Protein–RNA interactions for Protein: P23812

Hoxd12, Homeobox protein Hox-D12, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd12P23812 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxd12P23812 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxd12P23812 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxd12P23812 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxd12P23812 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxd12P23812 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxd12P23812 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxd12P23812 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxd12P23812 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxd12P23812 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxd12P23812 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxd12P23812 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxd12P23812 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxd12P23812 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxd12P23812 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxd12P23812 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxd12P23812 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxd12P23812 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxd12P23812 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxd12P23812 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxd12P23812 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxd12P23812 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxd12P23812 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxd12P23812 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxd12P23812 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxd12P23812 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxd12P23812 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxd12P23812 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxd12P23812 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxd12P23812 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxd12P23812 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxd12P23812 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxd12P23812 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxd12P23812 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxd12P23812 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxd12P23812 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxd12P23812 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxd12P23812 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxd12P23812 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxd12P23812 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxd12P23812 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxd12P23812 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxd12P23812 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxd12P23812 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxd12P23812 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxd12P23812 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxd12P23812 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxd12P23812 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxd12P23812 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxd12P23812 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxd12P23812 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxd12P23812 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxd12P23812 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxd12P23812 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxd12P23812 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxd12P23812 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxd12P23812 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxd12P23812 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxd12P23812 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxd12P23812 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxd12P23812 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxd12P23812 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxd12P23812 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxd12P23812 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxd12P23812 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxd12P23812 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxd12P23812 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxd12P23812 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxd12P23812 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxd12P23812 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxd12P23812 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxd12P23812 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxd12P23812 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxd12P23812 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxd12P23812 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxd12P23812 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxd12P23812 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Hoxd12P23812 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC16.89■□□□□ 0.3
Hoxd12P23812 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Hoxd12P23812 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Hoxd12P23812 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Hoxd12P23812 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxd12P23812 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxd12P23812 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxd12P23812 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxd12P23812 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxd12P23812 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxd12P23812 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxd12P23812 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxd12P23812 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxd12P23812 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxd12P23812 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxd12P23812 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxd12P23812 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxd12P23812 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxd12P23812 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxd12P23812 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxd12P23812 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxd12P23812 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxd12P23812 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84 ms