Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Ggta1P23336 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ggta1P23336 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Ggta1P23336 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ggta1P23336 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ggta1P23336 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ggta1P23336 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ggta1P23336 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ggta1P23336 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ggta1P23336 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Ggta1P23336 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Ggta1P23336 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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Ggta1P23336 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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Ggta1P23336 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Ggta1P23336 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Ggta1P23336 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Ggta1P23336 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Ggta1P23336 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ggta1P23336 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Ggta1P23336 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Ggta1P23336 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms