Protein–RNA interactions for Protein: P23198

Cbx3, Chromobox protein homolog 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx3P23198 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cbx3P23198 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cbx3P23198 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cbx3P23198 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cbx3P23198 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cbx3P23198 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cbx3P23198 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cbx3P23198 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cbx3P23198 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cbx3P23198 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cbx3P23198 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cbx3P23198 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cbx3P23198 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cbx3P23198 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cbx3P23198 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cbx3P23198 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cbx3P23198 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cbx3P23198 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cbx3P23198 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cbx3P23198 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cbx3P23198 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cbx3P23198 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cbx3P23198 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cbx3P23198 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cbx3P23198 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cbx3P23198 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cbx3P23198 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cbx3P23198 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cbx3P23198 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cbx3P23198 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cbx3P23198 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cbx3P23198 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cbx3P23198 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cbx3P23198 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cbx3P23198 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cbx3P23198 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cbx3P23198 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cbx3P23198 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cbx3P23198 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cbx3P23198 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cbx3P23198 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cbx3P23198 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cbx3P23198 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cbx3P23198 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cbx3P23198 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cbx3P23198 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cbx3P23198 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cbx3P23198 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cbx3P23198 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cbx3P23198 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cbx3P23198 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cbx3P23198 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cbx3P23198 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cbx3P23198 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cbx3P23198 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cbx3P23198 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cbx3P23198 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cbx3P23198 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cbx3P23198 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cbx3P23198 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cbx3P23198 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cbx3P23198 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cbx3P23198 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cbx3P23198 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cbx3P23198 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cbx3P23198 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cbx3P23198 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cbx3P23198 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cbx3P23198 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cbx3P23198 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cbx3P23198 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cbx3P23198 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cbx3P23198 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cbx3P23198 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cbx3P23198 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cbx3P23198 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cbx3P23198 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cbx3P23198 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cbx3P23198 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cbx3P23198 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cbx3P23198 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cbx3P23198 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cbx3P23198 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cbx3P23198 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cbx3P23198 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cbx3P23198 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cbx3P23198 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cbx3P23198 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cbx3P23198 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cbx3P23198 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cbx3P23198 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cbx3P23198 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cbx3P23198 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cbx3P23198 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cbx3P23198 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cbx3P23198 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cbx3P23198 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cbx3P23198 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cbx3P23198 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cbx3P23198 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms