Protein–RNA interactions for Protein: P21952

Pou3f1, POU domain, class 3, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou3f1P21952 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pou3f1P21952 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pou3f1P21952 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pou3f1P21952 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pou3f1P21952 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pou3f1P21952 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pou3f1P21952 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pou3f1P21952 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pou3f1P21952 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pou3f1P21952 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pou3f1P21952 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pou3f1P21952 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pou3f1P21952 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pou3f1P21952 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pou3f1P21952 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pou3f1P21952 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pou3f1P21952 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pou3f1P21952 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pou3f1P21952 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pou3f1P21952 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Pou3f1P21952 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Pou3f1P21952 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Pou3f1P21952 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pou3f1P21952 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pou3f1P21952 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pou3f1P21952 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pou3f1P21952 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pou3f1P21952 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pou3f1P21952 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pou3f1P21952 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pou3f1P21952 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pou3f1P21952 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Pou3f1P21952 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pou3f1P21952 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pou3f1P21952 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pou3f1P21952 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pou3f1P21952 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pou3f1P21952 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pou3f1P21952 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pou3f1P21952 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pou3f1P21952 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pou3f1P21952 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pou3f1P21952 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pou3f1P21952 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pou3f1P21952 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pou3f1P21952 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pou3f1P21952 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pou3f1P21952 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pou3f1P21952 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pou3f1P21952 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pou3f1P21952 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pou3f1P21952 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pou3f1P21952 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pou3f1P21952 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pou3f1P21952 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pou3f1P21952 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pou3f1P21952 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pou3f1P21952 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pou3f1P21952 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pou3f1P21952 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pou3f1P21952 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pou3f1P21952 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pou3f1P21952 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pou3f1P21952 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pou3f1P21952 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pou3f1P21952 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pou3f1P21952 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Pou3f1P21952 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Pou3f1P21952 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Pou3f1P21952 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Pou3f1P21952 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pou3f1P21952 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pou3f1P21952 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pou3f1P21952 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pou3f1P21952 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Pou3f1P21952 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pou3f1P21952 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pou3f1P21952 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pou3f1P21952 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pou3f1P21952 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pou3f1P21952 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pou3f1P21952 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pou3f1P21952 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pou3f1P21952 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pou3f1P21952 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pou3f1P21952 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pou3f1P21952 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pou3f1P21952 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pou3f1P21952 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pou3f1P21952 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Pou3f1P21952 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pou3f1P21952 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pou3f1P21952 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pou3f1P21952 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Pou3f1P21952 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pou3f1P21952 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pou3f1P21952 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pou3f1P21952 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Pou3f1P21952 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pou3f1P21952 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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