Protein–RNA interactions for Protein: P21841

Sftpc, Pulmonary surfactant-associated protein C, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpcP21841 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SftpcP21841 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SftpcP21841 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SftpcP21841 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SftpcP21841 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SftpcP21841 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SftpcP21841 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SftpcP21841 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SftpcP21841 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SftpcP21841 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SftpcP21841 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SftpcP21841 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SftpcP21841 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SftpcP21841 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SftpcP21841 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SftpcP21841 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SftpcP21841 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SftpcP21841 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SftpcP21841 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SftpcP21841 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SftpcP21841 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SftpcP21841 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SftpcP21841 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SftpcP21841 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SftpcP21841 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SftpcP21841 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SftpcP21841 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SftpcP21841 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SftpcP21841 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SftpcP21841 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SftpcP21841 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SftpcP21841 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SftpcP21841 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SftpcP21841 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SftpcP21841 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SftpcP21841 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SftpcP21841 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SftpcP21841 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SftpcP21841 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SftpcP21841 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SftpcP21841 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SftpcP21841 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SftpcP21841 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SftpcP21841 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SftpcP21841 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SftpcP21841 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SftpcP21841 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SftpcP21841 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SftpcP21841 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SftpcP21841 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SftpcP21841 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SftpcP21841 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SftpcP21841 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SftpcP21841 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SftpcP21841 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SftpcP21841 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SftpcP21841 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SftpcP21841 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SftpcP21841 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SftpcP21841 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SftpcP21841 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SftpcP21841 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SftpcP21841 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SftpcP21841 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SftpcP21841 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SftpcP21841 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SftpcP21841 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SftpcP21841 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SftpcP21841 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SftpcP21841 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SftpcP21841 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SftpcP21841 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SftpcP21841 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SftpcP21841 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SftpcP21841 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SftpcP21841 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SftpcP21841 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SftpcP21841 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SftpcP21841 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SftpcP21841 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SftpcP21841 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SftpcP21841 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SftpcP21841 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SftpcP21841 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SftpcP21841 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SftpcP21841 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SftpcP21841 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SftpcP21841 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SftpcP21841 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SftpcP21841 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SftpcP21841 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SftpcP21841 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SftpcP21841 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SftpcP21841 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SftpcP21841 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SftpcP21841 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SftpcP21841 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SftpcP21841 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SftpcP21841 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SftpcP21841 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms