Protein–RNA interactions for Protein: P20937

Klra1, T-cell surface glycoprotein YE1/48, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klra1P20937 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Klra1P20937 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Klra1P20937 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Klra1P20937 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Klra1P20937 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Klra1P20937 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Klra1P20937 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Klra1P20937 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Klra1P20937 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Klra1P20937 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Klra1P20937 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Klra1P20937 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Klra1P20937 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Klra1P20937 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Klra1P20937 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Klra1P20937 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Klra1P20937 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Klra1P20937 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Klra1P20937 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Klra1P20937 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Klra1P20937 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Klra1P20937 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Klra1P20937 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Klra1P20937 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Klra1P20937 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Klra1P20937 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Klra1P20937 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Klra1P20937 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Klra1P20937 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Klra1P20937 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Klra1P20937 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Klra1P20937 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Klra1P20937 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Klra1P20937 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Klra1P20937 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Klra1P20937 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Klra1P20937 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Klra1P20937 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Klra1P20937 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Klra1P20937 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Klra1P20937 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Klra1P20937 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Klra1P20937 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Klra1P20937 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Klra1P20937 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Klra1P20937 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Klra1P20937 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Klra1P20937 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Klra1P20937 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Klra1P20937 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Klra1P20937 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Klra1P20937 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Klra1P20937 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Klra1P20937 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Klra1P20937 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Klra1P20937 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Klra1P20937 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Klra1P20937 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Klra1P20937 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Klra1P20937 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Klra1P20937 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Klra1P20937 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Klra1P20937 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Klra1P20937 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Klra1P20937 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Klra1P20937 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Klra1P20937 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Klra1P20937 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Klra1P20937 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Klra1P20937 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Klra1P20937 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Klra1P20937 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Klra1P20937 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Klra1P20937 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Klra1P20937 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Klra1P20937 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Klra1P20937 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Klra1P20937 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Klra1P20937 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Klra1P20937 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Klra1P20937 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Klra1P20937 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Klra1P20937 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Klra1P20937 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Klra1P20937 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Klra1P20937 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Klra1P20937 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Klra1P20937 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Klra1P20937 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Klra1P20937 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Klra1P20937 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Klra1P20937 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Klra1P20937 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Klra1P20937 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Klra1P20937 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Klra1P20937 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Klra1P20937 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Klra1P20937 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Klra1P20937 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Klra1P20937 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms