Protein–RNA interactions for Protein: P20263

Pou5f1, POU domain, class 5, transcription factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou5f1P20263 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pou5f1P20263 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pou5f1P20263 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pou5f1P20263 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pou5f1P20263 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pou5f1P20263 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pou5f1P20263 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pou5f1P20263 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pou5f1P20263 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pou5f1P20263 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Pou5f1P20263 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pou5f1P20263 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pou5f1P20263 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pou5f1P20263 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pou5f1P20263 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Pou5f1P20263 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Pou5f1P20263 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pou5f1P20263 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Pou5f1P20263 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Pou5f1P20263 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Pou5f1P20263 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pou5f1P20263 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pou5f1P20263 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pou5f1P20263 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Pou5f1P20263 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Pou5f1P20263 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Pou5f1P20263 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Pou5f1P20263 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pou5f1P20263 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Pou5f1P20263 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pou5f1P20263 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pou5f1P20263 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pou5f1P20263 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pou5f1P20263 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pou5f1P20263 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pou5f1P20263 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pou5f1P20263 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pou5f1P20263 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pou5f1P20263 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pou5f1P20263 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pou5f1P20263 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pou5f1P20263 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pou5f1P20263 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pou5f1P20263 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pou5f1P20263 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pou5f1P20263 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pou5f1P20263 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pou5f1P20263 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pou5f1P20263 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pou5f1P20263 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Pou5f1P20263 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pou5f1P20263 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pou5f1P20263 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pou5f1P20263 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pou5f1P20263 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pou5f1P20263 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pou5f1P20263 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pou5f1P20263 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pou5f1P20263 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pou5f1P20263 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Pou5f1P20263 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pou5f1P20263 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pou5f1P20263 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pou5f1P20263 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pou5f1P20263 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pou5f1P20263 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pou5f1P20263 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pou5f1P20263 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pou5f1P20263 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pou5f1P20263 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pou5f1P20263 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pou5f1P20263 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pou5f1P20263 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pou5f1P20263 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pou5f1P20263 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pou5f1P20263 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pou5f1P20263 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pou5f1P20263 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pou5f1P20263 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pou5f1P20263 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pou5f1P20263 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pou5f1P20263 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Pou5f1P20263 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pou5f1P20263 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pou5f1P20263 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pou5f1P20263 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pou5f1P20263 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pou5f1P20263 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pou5f1P20263 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pou5f1P20263 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pou5f1P20263 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pou5f1P20263 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pou5f1P20263 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pou5f1P20263 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pou5f1P20263 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pou5f1P20263 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pou5f1P20263 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pou5f1P20263 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pou5f1P20263 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pou5f1P20263 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms