Protein–RNA interactions for Protein: P20181

Ntf3, Neurotrophin-3, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ntf3P20181 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ntf3P20181 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ntf3P20181 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ntf3P20181 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ntf3P20181 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ntf3P20181 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ntf3P20181 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ntf3P20181 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ntf3P20181 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ntf3P20181 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ntf3P20181 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ntf3P20181 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ntf3P20181 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ntf3P20181 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ntf3P20181 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ntf3P20181 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ntf3P20181 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ntf3P20181 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ntf3P20181 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ntf3P20181 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ntf3P20181 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ntf3P20181 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ntf3P20181 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ntf3P20181 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ntf3P20181 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ntf3P20181 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ntf3P20181 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ntf3P20181 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ntf3P20181 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ntf3P20181 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ntf3P20181 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ntf3P20181 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ntf3P20181 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ntf3P20181 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ntf3P20181 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ntf3P20181 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ntf3P20181 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ntf3P20181 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ntf3P20181 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ntf3P20181 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ntf3P20181 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ntf3P20181 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ntf3P20181 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ntf3P20181 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ntf3P20181 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ntf3P20181 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ntf3P20181 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ntf3P20181 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ntf3P20181 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ntf3P20181 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ntf3P20181 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ntf3P20181 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ntf3P20181 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ntf3P20181 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ntf3P20181 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ntf3P20181 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ntf3P20181 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ntf3P20181 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ntf3P20181 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ntf3P20181 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ntf3P20181 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ntf3P20181 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ntf3P20181 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ntf3P20181 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ntf3P20181 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ntf3P20181 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ntf3P20181 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ntf3P20181 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ntf3P20181 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ntf3P20181 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ntf3P20181 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ntf3P20181 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ntf3P20181 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ntf3P20181 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ntf3P20181 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ntf3P20181 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Ntf3P20181 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ntf3P20181 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ntf3P20181 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ntf3P20181 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ntf3P20181 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ntf3P20181 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ntf3P20181 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ntf3P20181 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ntf3P20181 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ntf3P20181 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ntf3P20181 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ntf3P20181 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ntf3P20181 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ntf3P20181 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ntf3P20181 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ntf3P20181 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ntf3P20181 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ntf3P20181 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ntf3P20181 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ntf3P20181 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ntf3P20181 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ntf3P20181 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ntf3P20181 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ntf3P20181 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms