Protein–RNA interactions for Protein: P19246

Nefh, Neurofilament heavy polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefhP19246 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NefhP19246 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NefhP19246 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NefhP19246 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NefhP19246 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NefhP19246 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
NefhP19246 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NefhP19246 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
NefhP19246 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NefhP19246 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NefhP19246 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NefhP19246 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
NefhP19246 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NefhP19246 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NefhP19246 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NefhP19246 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
NefhP19246 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NefhP19246 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NefhP19246 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NefhP19246 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NefhP19246 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NefhP19246 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NefhP19246 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NefhP19246 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NefhP19246 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NefhP19246 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NefhP19246 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NefhP19246 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NefhP19246 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NefhP19246 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NefhP19246 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NefhP19246 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NefhP19246 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NefhP19246 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NefhP19246 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NefhP19246 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NefhP19246 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
NefhP19246 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NefhP19246 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NefhP19246 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NefhP19246 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NefhP19246 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NefhP19246 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NefhP19246 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NefhP19246 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NefhP19246 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NefhP19246 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NefhP19246 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NefhP19246 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NefhP19246 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NefhP19246 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NefhP19246 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NefhP19246 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NefhP19246 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NefhP19246 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NefhP19246 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NefhP19246 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NefhP19246 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NefhP19246 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NefhP19246 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NefhP19246 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NefhP19246 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NefhP19246 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NefhP19246 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NefhP19246 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NefhP19246 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NefhP19246 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NefhP19246 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NefhP19246 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NefhP19246 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NefhP19246 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NefhP19246 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NefhP19246 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NefhP19246 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NefhP19246 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NefhP19246 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NefhP19246 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NefhP19246 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NefhP19246 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NefhP19246 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NefhP19246 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NefhP19246 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NefhP19246 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
NefhP19246 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
NefhP19246 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NefhP19246 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NefhP19246 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NefhP19246 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NefhP19246 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
NefhP19246 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NefhP19246 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NefhP19246 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NefhP19246 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NefhP19246 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NefhP19246 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NefhP19246 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NefhP19246 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NefhP19246 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NefhP19246 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NefhP19246 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
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