Protein–RNA interactions for Protein: P19182

Ifrd1, Interferon-related developmental regulator 1, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifrd1P19182 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ifrd1P19182 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Ifrd1P19182 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ifrd1P19182 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ifrd1P19182 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ifrd1P19182 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Ifrd1P19182 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ifrd1P19182 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Ifrd1P19182 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Ifrd1P19182 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ifrd1P19182 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ifrd1P19182 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Ifrd1P19182 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ifrd1P19182 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ifrd1P19182 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ifrd1P19182 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ifrd1P19182 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ifrd1P19182 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ifrd1P19182 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ifrd1P19182 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ifrd1P19182 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ifrd1P19182 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ifrd1P19182 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ifrd1P19182 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ifrd1P19182 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ifrd1P19182 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ifrd1P19182 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Ifrd1P19182 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ifrd1P19182 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Ifrd1P19182 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ifrd1P19182 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ifrd1P19182 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ifrd1P19182 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ifrd1P19182 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ifrd1P19182 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ifrd1P19182 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ifrd1P19182 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ifrd1P19182 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ifrd1P19182 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ifrd1P19182 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ifrd1P19182 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ifrd1P19182 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ifrd1P19182 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ifrd1P19182 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ifrd1P19182 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ifrd1P19182 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ifrd1P19182 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ifrd1P19182 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ifrd1P19182 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ifrd1P19182 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ifrd1P19182 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ifrd1P19182 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ifrd1P19182 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ifrd1P19182 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Ifrd1P19182 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ifrd1P19182 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ifrd1P19182 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ifrd1P19182 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ifrd1P19182 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ifrd1P19182 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ifrd1P19182 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ifrd1P19182 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ifrd1P19182 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ifrd1P19182 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ifrd1P19182 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ifrd1P19182 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ifrd1P19182 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ifrd1P19182 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ifrd1P19182 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ifrd1P19182 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ifrd1P19182 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ifrd1P19182 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ifrd1P19182 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ifrd1P19182 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ifrd1P19182 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Ifrd1P19182 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Ifrd1P19182 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ifrd1P19182 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ifrd1P19182 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ifrd1P19182 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ifrd1P19182 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ifrd1P19182 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ifrd1P19182 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ifrd1P19182 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ifrd1P19182 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ifrd1P19182 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ifrd1P19182 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ifrd1P19182 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Ifrd1P19182 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ifrd1P19182 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ifrd1P19182 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ifrd1P19182 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ifrd1P19182 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ifrd1P19182 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ifrd1P19182 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ifrd1P19182 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ifrd1P19182 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ifrd1P19182 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ifrd1P19182 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ifrd1P19182 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms