Protein–RNA interactions for Protein: P19123

Tnnc1, Troponin C, slow skeletal and cardiac muscles, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc1P19123 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tnnc1P19123 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tnnc1P19123 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tnnc1P19123 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tnnc1P19123 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tnnc1P19123 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tnnc1P19123 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tnnc1P19123 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Tnnc1P19123 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tnnc1P19123 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tnnc1P19123 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tnnc1P19123 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnnc1P19123 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnnc1P19123 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnnc1P19123 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnnc1P19123 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnnc1P19123 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnnc1P19123 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnnc1P19123 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnnc1P19123 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnnc1P19123 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnnc1P19123 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnnc1P19123 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnnc1P19123 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnnc1P19123 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnnc1P19123 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnnc1P19123 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Tnnc1P19123 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Tnnc1P19123 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnnc1P19123 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnnc1P19123 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnnc1P19123 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnnc1P19123 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnnc1P19123 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnnc1P19123 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnnc1P19123 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnnc1P19123 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnnc1P19123 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnnc1P19123 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnnc1P19123 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnnc1P19123 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnnc1P19123 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnnc1P19123 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnnc1P19123 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnnc1P19123 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnnc1P19123 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnnc1P19123 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnnc1P19123 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnnc1P19123 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnnc1P19123 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnnc1P19123 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnnc1P19123 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnnc1P19123 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnnc1P19123 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnnc1P19123 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnnc1P19123 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnnc1P19123 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnnc1P19123 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnnc1P19123 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnnc1P19123 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnnc1P19123 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnnc1P19123 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnnc1P19123 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnnc1P19123 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnnc1P19123 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnnc1P19123 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnnc1P19123 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnnc1P19123 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnnc1P19123 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnnc1P19123 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnnc1P19123 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnnc1P19123 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnnc1P19123 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnnc1P19123 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnnc1P19123 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnnc1P19123 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnnc1P19123 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnnc1P19123 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnnc1P19123 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnnc1P19123 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnnc1P19123 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnnc1P19123 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnnc1P19123 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnnc1P19123 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnnc1P19123 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnnc1P19123 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnnc1P19123 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnnc1P19123 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnnc1P19123 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnnc1P19123 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnnc1P19123 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnnc1P19123 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnnc1P19123 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnnc1P19123 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnnc1P19123 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnnc1P19123 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnnc1P19123 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnnc1P19123 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnnc1P19123 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnnc1P19123 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms