Protein–RNA interactions for Protein: P18533

Ig heavy chain V region 733, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18533 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P18533 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P18533 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P18533 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P18533 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P18533 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P18533 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P18533 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P18533 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P18533 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P18533 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P18533 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P18533 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P18533 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P18533 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P18533 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P18533 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P18533 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P18533 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
P18533 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P18533 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P18533 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
P18533 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
P18533 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P18533 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
P18533 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P18533 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P18533 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P18533 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P18533 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P18533 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P18533 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P18533 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P18533 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P18533 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P18533 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P18533 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P18533 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P18533 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P18533 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P18533 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P18533 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P18533 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P18533 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P18533 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P18533 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P18533 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
P18533 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P18533 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
P18533 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P18533 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P18533 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P18533 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P18533 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P18533 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P18533 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P18533 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P18533 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P18533 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P18533 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P18533 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P18533 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P18533 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P18533 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P18533 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P18533 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P18533 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P18533 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P18533 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P18533 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P18533 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
P18533 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
P18533 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P18533 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
P18533 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P18533 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P18533 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
P18533 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P18533 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P18533 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P18533 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P18533 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P18533 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P18533 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P18533 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
P18533 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P18533 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P18533 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P18533 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P18533 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P18533 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P18533 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P18533 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P18533 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P18533 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P18533 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
P18533 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P18533 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P18533 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P18533 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms