Protein–RNA interactions for Protein: P18529

Ig heavy chain V region 5-76, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18529 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
P18529 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
P18529 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
P18529 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
P18529 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
P18529 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
P18529 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
P18529 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
P18529 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
P18529 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
P18529 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
P18529 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
P18529 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
P18529 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
P18529 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
P18529 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
P18529 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
P18529 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
P18529 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
P18529 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
P18529 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
P18529 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
P18529 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
P18529 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
P18529 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
P18529 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
P18529 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
P18529 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
P18529 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
P18529 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
P18529 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
P18529 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
P18529 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
P18529 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
P18529 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
P18529 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
P18529 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
P18529 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
P18529 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
P18529 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
P18529 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
P18529 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
P18529 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
P18529 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
P18529 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
P18529 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
P18529 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
P18529 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
P18529 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
P18529 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
P18529 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
P18529 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
P18529 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
P18529 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
P18529 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
P18529 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
P18529 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
P18529 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
P18529 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
P18529 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
P18529 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
P18529 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
P18529 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
P18529 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
P18529 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
P18529 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
P18529 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
P18529 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
P18529 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
P18529 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
P18529 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
P18529 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
P18529 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
P18529 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
P18529 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
P18529 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
P18529 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
P18529 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
P18529 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
P18529 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
P18529 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
P18529 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
P18529 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
P18529 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
P18529 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
P18529 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
P18529 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
P18529 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
P18529 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
P18529 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
P18529 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
P18529 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
P18529 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
P18529 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
P18529 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
P18529 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
P18529 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
P18529 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
P18529 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
P18529 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms